Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC90BQ9GZT6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC90BQ9GZT6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC90BQ9GZT6 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC90BQ9GZT6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC90BQ9GZT6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC90BQ9GZT6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC90BQ9GZT6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC90BQ9GZT6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC90BQ9GZT6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CCDC90BQ9GZT6 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC90BQ9GZT6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC90BQ9GZT6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC90BQ9GZT6 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC90BQ9GZT6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC90BQ9GZT6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC90BQ9GZT6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC90BQ9GZT6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC90BQ9GZT6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC90BQ9GZT6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC90BQ9GZT6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC90BQ9GZT6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC90BQ9GZT6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC90BQ9GZT6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC90BQ9GZT6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC90BQ9GZT6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC90BQ9GZT6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC90BQ9GZT6 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC90BQ9GZT6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC90BQ9GZT6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC90BQ9GZT6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC90BQ9GZT6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC90BQ9GZT6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC90BQ9GZT6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC90BQ9GZT6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC90BQ9GZT6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC90BQ9GZT6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC90BQ9GZT6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC90BQ9GZT6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC90BQ9GZT6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC90BQ9GZT6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC90BQ9GZT6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC90BQ9GZT6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC90BQ9GZT6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC90BQ9GZT6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC90BQ9GZT6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC90BQ9GZT6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC90BQ9GZT6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC90BQ9GZT6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC90BQ9GZT6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC90BQ9GZT6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC90BQ9GZT6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC90BQ9GZT6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC90BQ9GZT6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC90BQ9GZT6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC90BQ9GZT6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC90BQ9GZT6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC90BQ9GZT6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC90BQ9GZT6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC90BQ9GZT6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC90BQ9GZT6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC90BQ9GZT6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC90BQ9GZT6 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC90BQ9GZT6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC90BQ9GZT6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC90BQ9GZT6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC90BQ9GZT6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC90BQ9GZT6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC90BQ9GZT6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC90BQ9GZT6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC90BQ9GZT6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC90BQ9GZT6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC90BQ9GZT6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC90BQ9GZT6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC90BQ9GZT6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC90BQ9GZT6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC90BQ9GZT6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC90BQ9GZT6 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC90BQ9GZT6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC90BQ9GZT6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC90BQ9GZT6 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC90BQ9GZT6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC90BQ9GZT6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC90BQ9GZT6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC90BQ9GZT6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC90BQ9GZT6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC90BQ9GZT6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC90BQ9GZT6 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC90BQ9GZT6 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC90BQ9GZT6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC90BQ9GZT6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC90BQ9GZT6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC90BQ9GZT6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC90BQ9GZT6 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC90BQ9GZT6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC90BQ9GZT6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC90BQ9GZT6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC90BQ9GZT6 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC90BQ9GZT6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC90BQ9GZT6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94 ms