Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCSER1Q9C0I3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCSER1Q9C0I3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCSER1Q9C0I3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CCSER1Q9C0I3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCSER1Q9C0I3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCSER1Q9C0I3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCSER1Q9C0I3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCSER1Q9C0I3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCSER1Q9C0I3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCSER1Q9C0I3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCSER1Q9C0I3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCSER1Q9C0I3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCSER1Q9C0I3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCSER1Q9C0I3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CCSER1Q9C0I3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCSER1Q9C0I3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCSER1Q9C0I3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCSER1Q9C0I3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCSER1Q9C0I3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCSER1Q9C0I3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCSER1Q9C0I3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCSER1Q9C0I3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CCSER1Q9C0I3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CCSER1Q9C0I3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCSER1Q9C0I3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCSER1Q9C0I3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCSER1Q9C0I3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCSER1Q9C0I3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCSER1Q9C0I3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCSER1Q9C0I3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCSER1Q9C0I3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCSER1Q9C0I3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCSER1Q9C0I3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCSER1Q9C0I3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCSER1Q9C0I3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCSER1Q9C0I3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCSER1Q9C0I3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCSER1Q9C0I3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCSER1Q9C0I3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CCSER1Q9C0I3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCSER1Q9C0I3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCSER1Q9C0I3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCSER1Q9C0I3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCSER1Q9C0I3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCSER1Q9C0I3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCSER1Q9C0I3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCSER1Q9C0I3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCSER1Q9C0I3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CCSER1Q9C0I3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
CCSER1Q9C0I3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CCSER1Q9C0I3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCSER1Q9C0I3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCSER1Q9C0I3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCSER1Q9C0I3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CCSER1Q9C0I3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCSER1Q9C0I3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCSER1Q9C0I3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCSER1Q9C0I3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCSER1Q9C0I3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCSER1Q9C0I3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCSER1Q9C0I3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCSER1Q9C0I3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCSER1Q9C0I3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCSER1Q9C0I3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCSER1Q9C0I3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCSER1Q9C0I3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCSER1Q9C0I3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCSER1Q9C0I3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CCSER1Q9C0I3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCSER1Q9C0I3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCSER1Q9C0I3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCSER1Q9C0I3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCSER1Q9C0I3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCSER1Q9C0I3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CCSER1Q9C0I3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCSER1Q9C0I3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCSER1Q9C0I3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCSER1Q9C0I3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CCSER1Q9C0I3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCSER1Q9C0I3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCSER1Q9C0I3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCSER1Q9C0I3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCSER1Q9C0I3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCSER1Q9C0I3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCSER1Q9C0I3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CCSER1Q9C0I3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCSER1Q9C0I3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CCSER1Q9C0I3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CCSER1Q9C0I3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCSER1Q9C0I3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCSER1Q9C0I3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCSER1Q9C0I3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CCSER1Q9C0I3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCSER1Q9C0I3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCSER1Q9C0I3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCSER1Q9C0I3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCSER1Q9C0I3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCSER1Q9C0I3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CCSER1Q9C0I3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms