Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C9

UBE2O, (E3-independent) E2 ubiquitin-conjugating enzyme, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2OQ9C0C9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBE2OQ9C0C9 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
UBE2OQ9C0C9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBE2OQ9C0C9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBE2OQ9C0C9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBE2OQ9C0C9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBE2OQ9C0C9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBE2OQ9C0C9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBE2OQ9C0C9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
UBE2OQ9C0C9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBE2OQ9C0C9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBE2OQ9C0C9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBE2OQ9C0C9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBE2OQ9C0C9 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBE2OQ9C0C9 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBE2OQ9C0C9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBE2OQ9C0C9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBE2OQ9C0C9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBE2OQ9C0C9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
UBE2OQ9C0C9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBE2OQ9C0C9 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBE2OQ9C0C9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBE2OQ9C0C9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBE2OQ9C0C9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBE2OQ9C0C9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBE2OQ9C0C9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UBE2OQ9C0C9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
UBE2OQ9C0C9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBE2OQ9C0C9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBE2OQ9C0C9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBE2OQ9C0C9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBE2OQ9C0C9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBE2OQ9C0C9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBE2OQ9C0C9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBE2OQ9C0C9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBE2OQ9C0C9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBE2OQ9C0C9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBE2OQ9C0C9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBE2OQ9C0C9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
UBE2OQ9C0C9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBE2OQ9C0C9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBE2OQ9C0C9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
UBE2OQ9C0C9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBE2OQ9C0C9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBE2OQ9C0C9 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBE2OQ9C0C9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBE2OQ9C0C9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
UBE2OQ9C0C9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBE2OQ9C0C9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBE2OQ9C0C9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBE2OQ9C0C9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBE2OQ9C0C9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
UBE2OQ9C0C9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
UBE2OQ9C0C9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
UBE2OQ9C0C9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBE2OQ9C0C9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBE2OQ9C0C9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBE2OQ9C0C9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBE2OQ9C0C9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBE2OQ9C0C9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBE2OQ9C0C9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBE2OQ9C0C9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBE2OQ9C0C9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBE2OQ9C0C9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBE2OQ9C0C9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBE2OQ9C0C9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBE2OQ9C0C9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBE2OQ9C0C9 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBE2OQ9C0C9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBE2OQ9C0C9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBE2OQ9C0C9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBE2OQ9C0C9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBE2OQ9C0C9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBE2OQ9C0C9 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBE2OQ9C0C9 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBE2OQ9C0C9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBE2OQ9C0C9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
UBE2OQ9C0C9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBE2OQ9C0C9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBE2OQ9C0C9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBE2OQ9C0C9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
UBE2OQ9C0C9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBE2OQ9C0C9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBE2OQ9C0C9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBE2OQ9C0C9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBE2OQ9C0C9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBE2OQ9C0C9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBE2OQ9C0C9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBE2OQ9C0C9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBE2OQ9C0C9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBE2OQ9C0C9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBE2OQ9C0C9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
UBE2OQ9C0C9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBE2OQ9C0C9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBE2OQ9C0C9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
UBE2OQ9C0C9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
UBE2OQ9C0C9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
UBE2OQ9C0C9 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
UBE2OQ9C0C9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
UBE2OQ9C0C9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms