Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM8Q9BZR9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM8Q9BZR9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM8Q9BZR9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM8Q9BZR9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM8Q9BZR9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM8Q9BZR9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM8Q9BZR9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM8Q9BZR9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM8Q9BZR9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM8Q9BZR9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM8Q9BZR9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM8Q9BZR9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TRIM8Q9BZR9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM8Q9BZR9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM8Q9BZR9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM8Q9BZR9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM8Q9BZR9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM8Q9BZR9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM8Q9BZR9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM8Q9BZR9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM8Q9BZR9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM8Q9BZR9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM8Q9BZR9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM8Q9BZR9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM8Q9BZR9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM8Q9BZR9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM8Q9BZR9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM8Q9BZR9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM8Q9BZR9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM8Q9BZR9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM8Q9BZR9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM8Q9BZR9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM8Q9BZR9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM8Q9BZR9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM8Q9BZR9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM8Q9BZR9 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM8Q9BZR9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM8Q9BZR9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM8Q9BZR9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM8Q9BZR9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM8Q9BZR9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM8Q9BZR9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM8Q9BZR9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM8Q9BZR9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM8Q9BZR9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM8Q9BZR9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM8Q9BZR9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM8Q9BZR9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM8Q9BZR9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM8Q9BZR9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM8Q9BZR9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM8Q9BZR9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM8Q9BZR9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM8Q9BZR9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
TRIM8Q9BZR9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM8Q9BZR9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM8Q9BZR9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM8Q9BZR9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM8Q9BZR9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM8Q9BZR9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM8Q9BZR9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM8Q9BZR9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM8Q9BZR9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM8Q9BZR9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM8Q9BZR9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM8Q9BZR9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM8Q9BZR9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM8Q9BZR9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM8Q9BZR9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM8Q9BZR9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM8Q9BZR9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM8Q9BZR9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM8Q9BZR9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM8Q9BZR9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM8Q9BZR9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM8Q9BZR9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM8Q9BZR9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM8Q9BZR9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM8Q9BZR9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM8Q9BZR9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM8Q9BZR9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM8Q9BZR9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM8Q9BZR9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM8Q9BZR9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM8Q9BZR9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM8Q9BZR9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM8Q9BZR9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM8Q9BZR9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM8Q9BZR9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM8Q9BZR9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM8Q9BZR9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM8Q9BZR9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM8Q9BZR9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM8Q9BZR9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM8Q9BZR9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM8Q9BZR9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM8Q9BZR9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM8Q9BZR9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM8Q9BZR9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.3 ms