Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZC1

CELF4, CUGBP Elav-like family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF4Q9BZC1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CELF4Q9BZC1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CELF4Q9BZC1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CELF4Q9BZC1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CELF4Q9BZC1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CELF4Q9BZC1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CELF4Q9BZC1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CELF4Q9BZC1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CELF4Q9BZC1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CELF4Q9BZC1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CELF4Q9BZC1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CELF4Q9BZC1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CELF4Q9BZC1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CELF4Q9BZC1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CELF4Q9BZC1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CELF4Q9BZC1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CELF4Q9BZC1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CELF4Q9BZC1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CELF4Q9BZC1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CELF4Q9BZC1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CELF4Q9BZC1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CELF4Q9BZC1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CELF4Q9BZC1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CELF4Q9BZC1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CELF4Q9BZC1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CELF4Q9BZC1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CELF4Q9BZC1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CELF4Q9BZC1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CELF4Q9BZC1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CELF4Q9BZC1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CELF4Q9BZC1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CELF4Q9BZC1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CELF4Q9BZC1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CELF4Q9BZC1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CELF4Q9BZC1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CELF4Q9BZC1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CELF4Q9BZC1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CELF4Q9BZC1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CELF4Q9BZC1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CELF4Q9BZC1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CELF4Q9BZC1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CELF4Q9BZC1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CELF4Q9BZC1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CELF4Q9BZC1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CELF4Q9BZC1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CELF4Q9BZC1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CELF4Q9BZC1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CELF4Q9BZC1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CELF4Q9BZC1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CELF4Q9BZC1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CELF4Q9BZC1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CELF4Q9BZC1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CELF4Q9BZC1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CELF4Q9BZC1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CELF4Q9BZC1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CELF4Q9BZC1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CELF4Q9BZC1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CELF4Q9BZC1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CELF4Q9BZC1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CELF4Q9BZC1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CELF4Q9BZC1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CELF4Q9BZC1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CELF4Q9BZC1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CELF4Q9BZC1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CELF4Q9BZC1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CELF4Q9BZC1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CELF4Q9BZC1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CELF4Q9BZC1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CELF4Q9BZC1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CELF4Q9BZC1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CELF4Q9BZC1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CELF4Q9BZC1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CELF4Q9BZC1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CELF4Q9BZC1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CELF4Q9BZC1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CELF4Q9BZC1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CELF4Q9BZC1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CELF4Q9BZC1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CELF4Q9BZC1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CELF4Q9BZC1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CELF4Q9BZC1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CELF4Q9BZC1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CELF4Q9BZC1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CELF4Q9BZC1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CELF4Q9BZC1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CELF4Q9BZC1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CELF4Q9BZC1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CELF4Q9BZC1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CELF4Q9BZC1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CELF4Q9BZC1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CELF4Q9BZC1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CELF4Q9BZC1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CELF4Q9BZC1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CELF4Q9BZC1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CELF4Q9BZC1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CELF4Q9BZC1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CELF4Q9BZC1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CELF4Q9BZC1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CELF4Q9BZC1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CELF4Q9BZC1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.6 ms