Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZB8

CPEB1, Cytoplasmic polyadenylation element-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEB1Q9BZB8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CPEB1Q9BZB8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CPEB1Q9BZB8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CPEB1Q9BZB8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CPEB1Q9BZB8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CPEB1Q9BZB8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CPEB1Q9BZB8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CPEB1Q9BZB8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CPEB1Q9BZB8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CPEB1Q9BZB8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CPEB1Q9BZB8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CPEB1Q9BZB8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CPEB1Q9BZB8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CPEB1Q9BZB8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CPEB1Q9BZB8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CPEB1Q9BZB8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CPEB1Q9BZB8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CPEB1Q9BZB8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CPEB1Q9BZB8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CPEB1Q9BZB8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CPEB1Q9BZB8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CPEB1Q9BZB8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CPEB1Q9BZB8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CPEB1Q9BZB8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CPEB1Q9BZB8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CPEB1Q9BZB8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CPEB1Q9BZB8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CPEB1Q9BZB8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CPEB1Q9BZB8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CPEB1Q9BZB8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CPEB1Q9BZB8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CPEB1Q9BZB8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CPEB1Q9BZB8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CPEB1Q9BZB8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CPEB1Q9BZB8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CPEB1Q9BZB8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CPEB1Q9BZB8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CPEB1Q9BZB8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CPEB1Q9BZB8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CPEB1Q9BZB8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CPEB1Q9BZB8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CPEB1Q9BZB8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CPEB1Q9BZB8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CPEB1Q9BZB8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CPEB1Q9BZB8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CPEB1Q9BZB8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CPEB1Q9BZB8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CPEB1Q9BZB8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CPEB1Q9BZB8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CPEB1Q9BZB8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CPEB1Q9BZB8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CPEB1Q9BZB8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CPEB1Q9BZB8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CPEB1Q9BZB8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CPEB1Q9BZB8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CPEB1Q9BZB8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CPEB1Q9BZB8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CPEB1Q9BZB8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CPEB1Q9BZB8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CPEB1Q9BZB8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CPEB1Q9BZB8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CPEB1Q9BZB8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CPEB1Q9BZB8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CPEB1Q9BZB8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CPEB1Q9BZB8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPEB1Q9BZB8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPEB1Q9BZB8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPEB1Q9BZB8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPEB1Q9BZB8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPEB1Q9BZB8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPEB1Q9BZB8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPEB1Q9BZB8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPEB1Q9BZB8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPEB1Q9BZB8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPEB1Q9BZB8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPEB1Q9BZB8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CPEB1Q9BZB8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CPEB1Q9BZB8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CPEB1Q9BZB8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CPEB1Q9BZB8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CPEB1Q9BZB8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CPEB1Q9BZB8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CPEB1Q9BZB8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CPEB1Q9BZB8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CPEB1Q9BZB8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CPEB1Q9BZB8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CPEB1Q9BZB8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CPEB1Q9BZB8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CPEB1Q9BZB8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CPEB1Q9BZB8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CPEB1Q9BZB8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CPEB1Q9BZB8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CPEB1Q9BZB8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CPEB1Q9BZB8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CPEB1Q9BZB8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CPEB1Q9BZB8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CPEB1Q9BZB8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CPEB1Q9BZB8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CPEB1Q9BZB8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPEB1Q9BZB8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.7 ms