Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC8Q9BY41 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC8Q9BY41 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC8Q9BY41 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC8Q9BY41 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC8Q9BY41 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC8Q9BY41 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC8Q9BY41 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC8Q9BY41 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC8Q9BY41 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC8Q9BY41 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC8Q9BY41 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC8Q9BY41 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC8Q9BY41 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC8Q9BY41 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC8Q9BY41 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC8Q9BY41 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC8Q9BY41 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC8Q9BY41 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC8Q9BY41 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC8Q9BY41 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC8Q9BY41 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC8Q9BY41 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC8Q9BY41 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC8Q9BY41 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC8Q9BY41 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC8Q9BY41 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC8Q9BY41 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC8Q9BY41 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC8Q9BY41 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC8Q9BY41 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC8Q9BY41 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC8Q9BY41 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC8Q9BY41 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC8Q9BY41 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC8Q9BY41 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC8Q9BY41 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC8Q9BY41 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC8Q9BY41 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC8Q9BY41 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC8Q9BY41 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC8Q9BY41 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC8Q9BY41 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC8Q9BY41 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC8Q9BY41 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC8Q9BY41 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC8Q9BY41 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC8Q9BY41 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC8Q9BY41 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC8Q9BY41 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC8Q9BY41 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC8Q9BY41 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC8Q9BY41 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC8Q9BY41 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC8Q9BY41 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC8Q9BY41 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC8Q9BY41 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC8Q9BY41 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC8Q9BY41 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC8Q9BY41 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC8Q9BY41 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC8Q9BY41 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC8Q9BY41 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC8Q9BY41 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC8Q9BY41 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC8Q9BY41 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC8Q9BY41 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC8Q9BY41 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC8Q9BY41 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC8Q9BY41 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC8Q9BY41 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC8Q9BY41 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC8Q9BY41 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC8Q9BY41 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC8Q9BY41 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC8Q9BY41 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC8Q9BY41 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC8Q9BY41 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HDAC8Q9BY41 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC8Q9BY41 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC8Q9BY41 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC8Q9BY41 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC8Q9BY41 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC8Q9BY41 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC8Q9BY41 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC8Q9BY41 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC8Q9BY41 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC8Q9BY41 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC8Q9BY41 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC8Q9BY41 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC8Q9BY41 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC8Q9BY41 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC8Q9BY41 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC8Q9BY41 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC8Q9BY41 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC8Q9BY41 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC8Q9BY41 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC8Q9BY41 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC8Q9BY41 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC8Q9BY41 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms