Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXJ4

C1QTNF3, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3Q9BXJ4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1QTNF3Q9BXJ4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1QTNF3Q9BXJ4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1QTNF3Q9BXJ4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1QTNF3Q9BXJ4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1QTNF3Q9BXJ4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1QTNF3Q9BXJ4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1QTNF3Q9BXJ4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1QTNF3Q9BXJ4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1QTNF3Q9BXJ4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1QTNF3Q9BXJ4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1QTNF3Q9BXJ4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1QTNF3Q9BXJ4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1QTNF3Q9BXJ4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1QTNF3Q9BXJ4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1QTNF3Q9BXJ4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1QTNF3Q9BXJ4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1QTNF3Q9BXJ4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1QTNF3Q9BXJ4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
C1QTNF3Q9BXJ4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1QTNF3Q9BXJ4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1QTNF3Q9BXJ4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1QTNF3Q9BXJ4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1QTNF3Q9BXJ4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1QTNF3Q9BXJ4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1QTNF3Q9BXJ4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1QTNF3Q9BXJ4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1QTNF3Q9BXJ4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1QTNF3Q9BXJ4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1QTNF3Q9BXJ4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1QTNF3Q9BXJ4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
C1QTNF3Q9BXJ4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1QTNF3Q9BXJ4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1QTNF3Q9BXJ4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1QTNF3Q9BXJ4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1QTNF3Q9BXJ4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1QTNF3Q9BXJ4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
C1QTNF3Q9BXJ4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1QTNF3Q9BXJ4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1QTNF3Q9BXJ4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1QTNF3Q9BXJ4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1QTNF3Q9BXJ4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1QTNF3Q9BXJ4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1QTNF3Q9BXJ4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1QTNF3Q9BXJ4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1QTNF3Q9BXJ4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1QTNF3Q9BXJ4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1QTNF3Q9BXJ4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1QTNF3Q9BXJ4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1QTNF3Q9BXJ4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1QTNF3Q9BXJ4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1QTNF3Q9BXJ4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1QTNF3Q9BXJ4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1QTNF3Q9BXJ4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1QTNF3Q9BXJ4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1QTNF3Q9BXJ4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1QTNF3Q9BXJ4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1QTNF3Q9BXJ4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1QTNF3Q9BXJ4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1QTNF3Q9BXJ4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1QTNF3Q9BXJ4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1QTNF3Q9BXJ4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1QTNF3Q9BXJ4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1QTNF3Q9BXJ4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
C1QTNF3Q9BXJ4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1QTNF3Q9BXJ4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1QTNF3Q9BXJ4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1QTNF3Q9BXJ4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1QTNF3Q9BXJ4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1QTNF3Q9BXJ4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1QTNF3Q9BXJ4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1QTNF3Q9BXJ4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1QTNF3Q9BXJ4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1QTNF3Q9BXJ4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1QTNF3Q9BXJ4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1QTNF3Q9BXJ4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1QTNF3Q9BXJ4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1QTNF3Q9BXJ4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1QTNF3Q9BXJ4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1QTNF3Q9BXJ4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1QTNF3Q9BXJ4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1QTNF3Q9BXJ4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1QTNF3Q9BXJ4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
C1QTNF3Q9BXJ4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1QTNF3Q9BXJ4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1QTNF3Q9BXJ4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
C1QTNF3Q9BXJ4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
C1QTNF3Q9BXJ4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1QTNF3Q9BXJ4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1QTNF3Q9BXJ4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1QTNF3Q9BXJ4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1QTNF3Q9BXJ4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1QTNF3Q9BXJ4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1QTNF3Q9BXJ4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1QTNF3Q9BXJ4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1QTNF3Q9BXJ4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1QTNF3Q9BXJ4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1QTNF3Q9BXJ4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1QTNF3Q9BXJ4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1QTNF3Q9BXJ4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms