Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SALL3Q9BXA9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SALL3Q9BXA9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SALL3Q9BXA9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SALL3Q9BXA9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SALL3Q9BXA9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SALL3Q9BXA9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SALL3Q9BXA9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SALL3Q9BXA9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SALL3Q9BXA9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SALL3Q9BXA9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SALL3Q9BXA9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SALL3Q9BXA9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SALL3Q9BXA9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SALL3Q9BXA9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SALL3Q9BXA9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SALL3Q9BXA9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SALL3Q9BXA9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SALL3Q9BXA9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SALL3Q9BXA9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SALL3Q9BXA9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SALL3Q9BXA9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SALL3Q9BXA9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SALL3Q9BXA9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SALL3Q9BXA9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SALL3Q9BXA9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SALL3Q9BXA9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SALL3Q9BXA9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SALL3Q9BXA9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SALL3Q9BXA9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SALL3Q9BXA9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SALL3Q9BXA9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SALL3Q9BXA9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SALL3Q9BXA9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SALL3Q9BXA9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SALL3Q9BXA9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SALL3Q9BXA9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SALL3Q9BXA9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SALL3Q9BXA9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SALL3Q9BXA9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SALL3Q9BXA9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
SALL3Q9BXA9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SALL3Q9BXA9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SALL3Q9BXA9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SALL3Q9BXA9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SALL3Q9BXA9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SALL3Q9BXA9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SALL3Q9BXA9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SALL3Q9BXA9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SALL3Q9BXA9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SALL3Q9BXA9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SALL3Q9BXA9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SALL3Q9BXA9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SALL3Q9BXA9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SALL3Q9BXA9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SALL3Q9BXA9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SALL3Q9BXA9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SALL3Q9BXA9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SALL3Q9BXA9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SALL3Q9BXA9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SALL3Q9BXA9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SALL3Q9BXA9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SALL3Q9BXA9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SALL3Q9BXA9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SALL3Q9BXA9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
SALL3Q9BXA9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SALL3Q9BXA9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SALL3Q9BXA9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SALL3Q9BXA9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SALL3Q9BXA9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SALL3Q9BXA9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SALL3Q9BXA9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SALL3Q9BXA9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SALL3Q9BXA9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SALL3Q9BXA9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SALL3Q9BXA9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SALL3Q9BXA9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SALL3Q9BXA9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SALL3Q9BXA9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SALL3Q9BXA9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SALL3Q9BXA9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SALL3Q9BXA9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SALL3Q9BXA9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SALL3Q9BXA9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SALL3Q9BXA9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SALL3Q9BXA9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SALL3Q9BXA9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SALL3Q9BXA9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SALL3Q9BXA9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SALL3Q9BXA9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SALL3Q9BXA9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
SALL3Q9BXA9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SALL3Q9BXA9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SALL3Q9BXA9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SALL3Q9BXA9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
SALL3Q9BXA9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SALL3Q9BXA9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SALL3Q9BXA9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SALL3Q9BXA9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
SALL3Q9BXA9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 153.2 ms