Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX95

SGPP1, Sphingosine-1-phosphate phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGPP1Q9BX95 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGPP1Q9BX95 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGPP1Q9BX95 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGPP1Q9BX95 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGPP1Q9BX95 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGPP1Q9BX95 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGPP1Q9BX95 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SGPP1Q9BX95 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGPP1Q9BX95 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGPP1Q9BX95 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGPP1Q9BX95 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGPP1Q9BX95 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGPP1Q9BX95 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGPP1Q9BX95 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGPP1Q9BX95 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGPP1Q9BX95 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGPP1Q9BX95 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGPP1Q9BX95 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGPP1Q9BX95 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGPP1Q9BX95 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGPP1Q9BX95 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGPP1Q9BX95 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGPP1Q9BX95 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SGPP1Q9BX95 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGPP1Q9BX95 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGPP1Q9BX95 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGPP1Q9BX95 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGPP1Q9BX95 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGPP1Q9BX95 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SGPP1Q9BX95 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGPP1Q9BX95 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGPP1Q9BX95 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGPP1Q9BX95 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGPP1Q9BX95 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGPP1Q9BX95 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGPP1Q9BX95 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGPP1Q9BX95 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SGPP1Q9BX95 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGPP1Q9BX95 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGPP1Q9BX95 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGPP1Q9BX95 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGPP1Q9BX95 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGPP1Q9BX95 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGPP1Q9BX95 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGPP1Q9BX95 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGPP1Q9BX95 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGPP1Q9BX95 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGPP1Q9BX95 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGPP1Q9BX95 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGPP1Q9BX95 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGPP1Q9BX95 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGPP1Q9BX95 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGPP1Q9BX95 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGPP1Q9BX95 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGPP1Q9BX95 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGPP1Q9BX95 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGPP1Q9BX95 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SGPP1Q9BX95 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SGPP1Q9BX95 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SGPP1Q9BX95 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SGPP1Q9BX95 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SGPP1Q9BX95 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SGPP1Q9BX95 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGPP1Q9BX95 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGPP1Q9BX95 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGPP1Q9BX95 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SGPP1Q9BX95 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGPP1Q9BX95 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGPP1Q9BX95 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGPP1Q9BX95 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGPP1Q9BX95 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGPP1Q9BX95 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGPP1Q9BX95 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGPP1Q9BX95 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGPP1Q9BX95 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGPP1Q9BX95 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGPP1Q9BX95 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGPP1Q9BX95 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGPP1Q9BX95 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGPP1Q9BX95 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGPP1Q9BX95 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGPP1Q9BX95 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGPP1Q9BX95 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGPP1Q9BX95 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGPP1Q9BX95 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGPP1Q9BX95 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGPP1Q9BX95 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGPP1Q9BX95 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGPP1Q9BX95 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGPP1Q9BX95 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGPP1Q9BX95 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGPP1Q9BX95 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGPP1Q9BX95 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGPP1Q9BX95 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGPP1Q9BX95 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SGPP1Q9BX95 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGPP1Q9BX95 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGPP1Q9BX95 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGPP1Q9BX95 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGPP1Q9BX95 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms