Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVM2

DPCD, Protein DPCD, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DPCDQ9BVM2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DPCDQ9BVM2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DPCDQ9BVM2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DPCDQ9BVM2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DPCDQ9BVM2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DPCDQ9BVM2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DPCDQ9BVM2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DPCDQ9BVM2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DPCDQ9BVM2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
DPCDQ9BVM2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DPCDQ9BVM2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DPCDQ9BVM2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DPCDQ9BVM2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DPCDQ9BVM2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DPCDQ9BVM2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DPCDQ9BVM2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DPCDQ9BVM2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DPCDQ9BVM2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DPCDQ9BVM2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DPCDQ9BVM2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DPCDQ9BVM2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DPCDQ9BVM2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DPCDQ9BVM2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DPCDQ9BVM2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DPCDQ9BVM2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DPCDQ9BVM2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DPCDQ9BVM2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DPCDQ9BVM2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DPCDQ9BVM2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DPCDQ9BVM2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DPCDQ9BVM2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DPCDQ9BVM2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DPCDQ9BVM2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DPCDQ9BVM2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DPCDQ9BVM2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DPCDQ9BVM2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DPCDQ9BVM2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DPCDQ9BVM2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DPCDQ9BVM2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DPCDQ9BVM2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DPCDQ9BVM2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DPCDQ9BVM2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DPCDQ9BVM2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DPCDQ9BVM2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DPCDQ9BVM2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DPCDQ9BVM2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DPCDQ9BVM2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DPCDQ9BVM2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
DPCDQ9BVM2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DPCDQ9BVM2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DPCDQ9BVM2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DPCDQ9BVM2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DPCDQ9BVM2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DPCDQ9BVM2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DPCDQ9BVM2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DPCDQ9BVM2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DPCDQ9BVM2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
DPCDQ9BVM2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DPCDQ9BVM2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DPCDQ9BVM2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DPCDQ9BVM2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DPCDQ9BVM2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DPCDQ9BVM2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DPCDQ9BVM2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DPCDQ9BVM2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DPCDQ9BVM2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DPCDQ9BVM2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
DPCDQ9BVM2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DPCDQ9BVM2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DPCDQ9BVM2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DPCDQ9BVM2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DPCDQ9BVM2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DPCDQ9BVM2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DPCDQ9BVM2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DPCDQ9BVM2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DPCDQ9BVM2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DPCDQ9BVM2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DPCDQ9BVM2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DPCDQ9BVM2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DPCDQ9BVM2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DPCDQ9BVM2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DPCDQ9BVM2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DPCDQ9BVM2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DPCDQ9BVM2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DPCDQ9BVM2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DPCDQ9BVM2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DPCDQ9BVM2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DPCDQ9BVM2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DPCDQ9BVM2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DPCDQ9BVM2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
DPCDQ9BVM2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DPCDQ9BVM2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DPCDQ9BVM2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DPCDQ9BVM2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DPCDQ9BVM2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DPCDQ9BVM2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DPCDQ9BVM2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DPCDQ9BVM2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DPCDQ9BVM2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DPCDQ9BVM2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms