Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUP58Q9BVL2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUP58Q9BVL2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUP58Q9BVL2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUP58Q9BVL2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUP58Q9BVL2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUP58Q9BVL2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUP58Q9BVL2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUP58Q9BVL2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUP58Q9BVL2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP58Q9BVL2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP58Q9BVL2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP58Q9BVL2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP58Q9BVL2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP58Q9BVL2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP58Q9BVL2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUP58Q9BVL2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUP58Q9BVL2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUP58Q9BVL2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUP58Q9BVL2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUP58Q9BVL2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUP58Q9BVL2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUP58Q9BVL2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUP58Q9BVL2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUP58Q9BVL2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
NUP58Q9BVL2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUP58Q9BVL2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUP58Q9BVL2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUP58Q9BVL2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUP58Q9BVL2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUP58Q9BVL2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUP58Q9BVL2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUP58Q9BVL2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUP58Q9BVL2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUP58Q9BVL2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUP58Q9BVL2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NUP58Q9BVL2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUP58Q9BVL2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUP58Q9BVL2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP58Q9BVL2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP58Q9BVL2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP58Q9BVL2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP58Q9BVL2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP58Q9BVL2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP58Q9BVL2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP58Q9BVL2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP58Q9BVL2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP58Q9BVL2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP58Q9BVL2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP58Q9BVL2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUP58Q9BVL2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUP58Q9BVL2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUP58Q9BVL2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NUP58Q9BVL2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUP58Q9BVL2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUP58Q9BVL2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUP58Q9BVL2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUP58Q9BVL2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUP58Q9BVL2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUP58Q9BVL2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUP58Q9BVL2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUP58Q9BVL2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUP58Q9BVL2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUP58Q9BVL2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUP58Q9BVL2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUP58Q9BVL2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NUP58Q9BVL2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUP58Q9BVL2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUP58Q9BVL2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUP58Q9BVL2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUP58Q9BVL2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUP58Q9BVL2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUP58Q9BVL2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUP58Q9BVL2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUP58Q9BVL2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUP58Q9BVL2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NUP58Q9BVL2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUP58Q9BVL2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUP58Q9BVL2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUP58Q9BVL2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUP58Q9BVL2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUP58Q9BVL2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUP58Q9BVL2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUP58Q9BVL2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUP58Q9BVL2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUP58Q9BVL2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NUP58Q9BVL2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUP58Q9BVL2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP58Q9BVL2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP58Q9BVL2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP58Q9BVL2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP58Q9BVL2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP58Q9BVL2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP58Q9BVL2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP58Q9BVL2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP58Q9BVL2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUP58Q9BVL2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUP58Q9BVL2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUP58Q9BVL2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUP58Q9BVL2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.7 ms