Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG4

PBDC1, Protein PBDC1, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBDC1Q9BVG4 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PBDC1Q9BVG4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PBDC1Q9BVG4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PBDC1Q9BVG4 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PBDC1Q9BVG4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PBDC1Q9BVG4 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PBDC1Q9BVG4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PBDC1Q9BVG4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PBDC1Q9BVG4 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PBDC1Q9BVG4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PBDC1Q9BVG4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PBDC1Q9BVG4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PBDC1Q9BVG4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PBDC1Q9BVG4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PBDC1Q9BVG4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PBDC1Q9BVG4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PBDC1Q9BVG4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PBDC1Q9BVG4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PBDC1Q9BVG4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PBDC1Q9BVG4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PBDC1Q9BVG4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PBDC1Q9BVG4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PBDC1Q9BVG4 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PBDC1Q9BVG4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PBDC1Q9BVG4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PBDC1Q9BVG4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PBDC1Q9BVG4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PBDC1Q9BVG4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PBDC1Q9BVG4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PBDC1Q9BVG4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PBDC1Q9BVG4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PBDC1Q9BVG4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PBDC1Q9BVG4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PBDC1Q9BVG4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PBDC1Q9BVG4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PBDC1Q9BVG4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PBDC1Q9BVG4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PBDC1Q9BVG4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PBDC1Q9BVG4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PBDC1Q9BVG4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PBDC1Q9BVG4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PBDC1Q9BVG4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PBDC1Q9BVG4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PBDC1Q9BVG4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PBDC1Q9BVG4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PBDC1Q9BVG4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PBDC1Q9BVG4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PBDC1Q9BVG4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PBDC1Q9BVG4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PBDC1Q9BVG4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PBDC1Q9BVG4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PBDC1Q9BVG4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PBDC1Q9BVG4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PBDC1Q9BVG4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PBDC1Q9BVG4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PBDC1Q9BVG4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PBDC1Q9BVG4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PBDC1Q9BVG4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PBDC1Q9BVG4 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PBDC1Q9BVG4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PBDC1Q9BVG4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PBDC1Q9BVG4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PBDC1Q9BVG4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PBDC1Q9BVG4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PBDC1Q9BVG4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PBDC1Q9BVG4 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PBDC1Q9BVG4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PBDC1Q9BVG4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PBDC1Q9BVG4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PBDC1Q9BVG4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PBDC1Q9BVG4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PBDC1Q9BVG4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PBDC1Q9BVG4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PBDC1Q9BVG4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PBDC1Q9BVG4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PBDC1Q9BVG4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PBDC1Q9BVG4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PBDC1Q9BVG4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PBDC1Q9BVG4 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PBDC1Q9BVG4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PBDC1Q9BVG4 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PBDC1Q9BVG4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PBDC1Q9BVG4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PBDC1Q9BVG4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PBDC1Q9BVG4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PBDC1Q9BVG4 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PBDC1Q9BVG4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PBDC1Q9BVG4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PBDC1Q9BVG4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PBDC1Q9BVG4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PBDC1Q9BVG4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PBDC1Q9BVG4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PBDC1Q9BVG4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PBDC1Q9BVG4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PBDC1Q9BVG4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PBDC1Q9BVG4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PBDC1Q9BVG4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PBDC1Q9BVG4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PBDC1Q9BVG4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PBDC1Q9BVG4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms