Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU40

CHRDL1, Chordin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRDL1Q9BU40 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRDL1Q9BU40 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRDL1Q9BU40 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRDL1Q9BU40 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRDL1Q9BU40 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRDL1Q9BU40 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRDL1Q9BU40 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRDL1Q9BU40 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRDL1Q9BU40 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRDL1Q9BU40 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRDL1Q9BU40 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRDL1Q9BU40 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRDL1Q9BU40 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRDL1Q9BU40 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRDL1Q9BU40 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRDL1Q9BU40 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRDL1Q9BU40 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRDL1Q9BU40 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRDL1Q9BU40 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRDL1Q9BU40 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRDL1Q9BU40 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRDL1Q9BU40 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRDL1Q9BU40 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRDL1Q9BU40 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRDL1Q9BU40 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRDL1Q9BU40 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRDL1Q9BU40 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRDL1Q9BU40 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRDL1Q9BU40 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRDL1Q9BU40 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRDL1Q9BU40 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRDL1Q9BU40 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRDL1Q9BU40 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRDL1Q9BU40 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRDL1Q9BU40 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRDL1Q9BU40 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRDL1Q9BU40 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRDL1Q9BU40 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRDL1Q9BU40 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRDL1Q9BU40 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRDL1Q9BU40 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRDL1Q9BU40 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRDL1Q9BU40 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRDL1Q9BU40 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRDL1Q9BU40 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRDL1Q9BU40 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRDL1Q9BU40 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRDL1Q9BU40 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRDL1Q9BU40 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRDL1Q9BU40 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRDL1Q9BU40 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRDL1Q9BU40 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRDL1Q9BU40 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRDL1Q9BU40 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRDL1Q9BU40 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRDL1Q9BU40 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRDL1Q9BU40 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRDL1Q9BU40 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRDL1Q9BU40 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRDL1Q9BU40 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRDL1Q9BU40 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRDL1Q9BU40 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRDL1Q9BU40 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRDL1Q9BU40 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRDL1Q9BU40 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRDL1Q9BU40 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRDL1Q9BU40 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRDL1Q9BU40 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRDL1Q9BU40 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRDL1Q9BU40 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRDL1Q9BU40 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRDL1Q9BU40 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRDL1Q9BU40 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRDL1Q9BU40 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRDL1Q9BU40 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRDL1Q9BU40 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRDL1Q9BU40 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRDL1Q9BU40 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRDL1Q9BU40 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRDL1Q9BU40 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CHRDL1Q9BU40 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CHRDL1Q9BU40 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRDL1Q9BU40 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRDL1Q9BU40 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRDL1Q9BU40 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRDL1Q9BU40 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRDL1Q9BU40 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRDL1Q9BU40 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRDL1Q9BU40 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRDL1Q9BU40 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRDL1Q9BU40 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRDL1Q9BU40 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRDL1Q9BU40 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRDL1Q9BU40 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRDL1Q9BU40 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRDL1Q9BU40 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRDL1Q9BU40 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRDL1Q9BU40 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRDL1Q9BU40 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRDL1Q9BU40 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms