Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HERPUD2Q9BSE4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
HERPUD2Q9BSE4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HERPUD2Q9BSE4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HERPUD2Q9BSE4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HERPUD2Q9BSE4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HERPUD2Q9BSE4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HERPUD2Q9BSE4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HERPUD2Q9BSE4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HERPUD2Q9BSE4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HERPUD2Q9BSE4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HERPUD2Q9BSE4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HERPUD2Q9BSE4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HERPUD2Q9BSE4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HERPUD2Q9BSE4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HERPUD2Q9BSE4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HERPUD2Q9BSE4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HERPUD2Q9BSE4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HERPUD2Q9BSE4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HERPUD2Q9BSE4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HERPUD2Q9BSE4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HERPUD2Q9BSE4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HERPUD2Q9BSE4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HERPUD2Q9BSE4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HERPUD2Q9BSE4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HERPUD2Q9BSE4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HERPUD2Q9BSE4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HERPUD2Q9BSE4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HERPUD2Q9BSE4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HERPUD2Q9BSE4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HERPUD2Q9BSE4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HERPUD2Q9BSE4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HERPUD2Q9BSE4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HERPUD2Q9BSE4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HERPUD2Q9BSE4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HERPUD2Q9BSE4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HERPUD2Q9BSE4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HERPUD2Q9BSE4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HERPUD2Q9BSE4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HERPUD2Q9BSE4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HERPUD2Q9BSE4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HERPUD2Q9BSE4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HERPUD2Q9BSE4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HERPUD2Q9BSE4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HERPUD2Q9BSE4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HERPUD2Q9BSE4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HERPUD2Q9BSE4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HERPUD2Q9BSE4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HERPUD2Q9BSE4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HERPUD2Q9BSE4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HERPUD2Q9BSE4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HERPUD2Q9BSE4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
HERPUD2Q9BSE4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HERPUD2Q9BSE4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HERPUD2Q9BSE4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HERPUD2Q9BSE4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HERPUD2Q9BSE4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
HERPUD2Q9BSE4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HERPUD2Q9BSE4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HERPUD2Q9BSE4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HERPUD2Q9BSE4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HERPUD2Q9BSE4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HERPUD2Q9BSE4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HERPUD2Q9BSE4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HERPUD2Q9BSE4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HERPUD2Q9BSE4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HERPUD2Q9BSE4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HERPUD2Q9BSE4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HERPUD2Q9BSE4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HERPUD2Q9BSE4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HERPUD2Q9BSE4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HERPUD2Q9BSE4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HERPUD2Q9BSE4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HERPUD2Q9BSE4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HERPUD2Q9BSE4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HERPUD2Q9BSE4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HERPUD2Q9BSE4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HERPUD2Q9BSE4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HERPUD2Q9BSE4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HERPUD2Q9BSE4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HERPUD2Q9BSE4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HERPUD2Q9BSE4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HERPUD2Q9BSE4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HERPUD2Q9BSE4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HERPUD2Q9BSE4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HERPUD2Q9BSE4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HERPUD2Q9BSE4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HERPUD2Q9BSE4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HERPUD2Q9BSE4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HERPUD2Q9BSE4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HERPUD2Q9BSE4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HERPUD2Q9BSE4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HERPUD2Q9BSE4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
HERPUD2Q9BSE4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HERPUD2Q9BSE4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HERPUD2Q9BSE4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HERPUD2Q9BSE4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HERPUD2Q9BSE4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HERPUD2Q9BSE4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HERPUD2Q9BSE4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms