Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS16

CENPK, Centromere protein K, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPKQ9BS16 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CENPKQ9BS16 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CENPKQ9BS16 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CENPKQ9BS16 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CENPKQ9BS16 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CENPKQ9BS16 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CENPKQ9BS16 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPKQ9BS16 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPKQ9BS16 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPKQ9BS16 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPKQ9BS16 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPKQ9BS16 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPKQ9BS16 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPKQ9BS16 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPKQ9BS16 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPKQ9BS16 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPKQ9BS16 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPKQ9BS16 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPKQ9BS16 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPKQ9BS16 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPKQ9BS16 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPKQ9BS16 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPKQ9BS16 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPKQ9BS16 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPKQ9BS16 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPKQ9BS16 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPKQ9BS16 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPKQ9BS16 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CENPKQ9BS16 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CENPKQ9BS16 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CENPKQ9BS16 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CENPKQ9BS16 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CENPKQ9BS16 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CENPKQ9BS16 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CENPKQ9BS16 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CENPKQ9BS16 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CENPKQ9BS16 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CENPKQ9BS16 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPKQ9BS16 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPKQ9BS16 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPKQ9BS16 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPKQ9BS16 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPKQ9BS16 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPKQ9BS16 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPKQ9BS16 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPKQ9BS16 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPKQ9BS16 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPKQ9BS16 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPKQ9BS16 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPKQ9BS16 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPKQ9BS16 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPKQ9BS16 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPKQ9BS16 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPKQ9BS16 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPKQ9BS16 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPKQ9BS16 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPKQ9BS16 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPKQ9BS16 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPKQ9BS16 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPKQ9BS16 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPKQ9BS16 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPKQ9BS16 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPKQ9BS16 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPKQ9BS16 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPKQ9BS16 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPKQ9BS16 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPKQ9BS16 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPKQ9BS16 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPKQ9BS16 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPKQ9BS16 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPKQ9BS16 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPKQ9BS16 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPKQ9BS16 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPKQ9BS16 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPKQ9BS16 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPKQ9BS16 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPKQ9BS16 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPKQ9BS16 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPKQ9BS16 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPKQ9BS16 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPKQ9BS16 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPKQ9BS16 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPKQ9BS16 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CENPKQ9BS16 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CENPKQ9BS16 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CENPKQ9BS16 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CENPKQ9BS16 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPKQ9BS16 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPKQ9BS16 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPKQ9BS16 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPKQ9BS16 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPKQ9BS16 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPKQ9BS16 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPKQ9BS16 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPKQ9BS16 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPKQ9BS16 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPKQ9BS16 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPKQ9BS16 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPKQ9BS16 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPKQ9BS16 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms