Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK0

REEP2, Receptor expression-enhancing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP2Q9BRK0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
REEP2Q9BRK0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
REEP2Q9BRK0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
REEP2Q9BRK0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
REEP2Q9BRK0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
REEP2Q9BRK0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
REEP2Q9BRK0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
REEP2Q9BRK0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
REEP2Q9BRK0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
REEP2Q9BRK0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
REEP2Q9BRK0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
REEP2Q9BRK0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
REEP2Q9BRK0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
REEP2Q9BRK0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
REEP2Q9BRK0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
REEP2Q9BRK0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
REEP2Q9BRK0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
REEP2Q9BRK0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
REEP2Q9BRK0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
REEP2Q9BRK0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
REEP2Q9BRK0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
REEP2Q9BRK0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
REEP2Q9BRK0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
REEP2Q9BRK0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
REEP2Q9BRK0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
REEP2Q9BRK0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
REEP2Q9BRK0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
REEP2Q9BRK0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
REEP2Q9BRK0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
REEP2Q9BRK0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
REEP2Q9BRK0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
REEP2Q9BRK0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
REEP2Q9BRK0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
REEP2Q9BRK0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
REEP2Q9BRK0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
REEP2Q9BRK0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
REEP2Q9BRK0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
REEP2Q9BRK0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
REEP2Q9BRK0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
REEP2Q9BRK0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
REEP2Q9BRK0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
REEP2Q9BRK0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
REEP2Q9BRK0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
REEP2Q9BRK0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
REEP2Q9BRK0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
REEP2Q9BRK0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
REEP2Q9BRK0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
REEP2Q9BRK0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
REEP2Q9BRK0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
REEP2Q9BRK0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
REEP2Q9BRK0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
REEP2Q9BRK0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
REEP2Q9BRK0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
REEP2Q9BRK0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
REEP2Q9BRK0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
REEP2Q9BRK0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
REEP2Q9BRK0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
REEP2Q9BRK0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
REEP2Q9BRK0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
REEP2Q9BRK0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
REEP2Q9BRK0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
REEP2Q9BRK0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
REEP2Q9BRK0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
REEP2Q9BRK0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
REEP2Q9BRK0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
REEP2Q9BRK0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26■■□□□ 1.75
REEP2Q9BRK0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
REEP2Q9BRK0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
REEP2Q9BRK0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
REEP2Q9BRK0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
REEP2Q9BRK0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
REEP2Q9BRK0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
REEP2Q9BRK0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
REEP2Q9BRK0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
REEP2Q9BRK0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
REEP2Q9BRK0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
REEP2Q9BRK0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
REEP2Q9BRK0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
REEP2Q9BRK0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
REEP2Q9BRK0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
REEP2Q9BRK0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
REEP2Q9BRK0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
REEP2Q9BRK0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
REEP2Q9BRK0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
REEP2Q9BRK0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
REEP2Q9BRK0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
REEP2Q9BRK0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
REEP2Q9BRK0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
REEP2Q9BRK0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
REEP2Q9BRK0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
REEP2Q9BRK0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
REEP2Q9BRK0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
REEP2Q9BRK0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
REEP2Q9BRK0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
REEP2Q9BRK0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
REEP2Q9BRK0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
REEP2Q9BRK0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
REEP2Q9BRK0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
REEP2Q9BRK0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
REEP2Q9BRK0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms