Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRA2

TXNDC17, Thioredoxin domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC17Q9BRA2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TXNDC17Q9BRA2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TXNDC17Q9BRA2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TXNDC17Q9BRA2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TXNDC17Q9BRA2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TXNDC17Q9BRA2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TXNDC17Q9BRA2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TXNDC17Q9BRA2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TXNDC17Q9BRA2 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TXNDC17Q9BRA2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TXNDC17Q9BRA2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TXNDC17Q9BRA2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TXNDC17Q9BRA2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TXNDC17Q9BRA2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TXNDC17Q9BRA2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TXNDC17Q9BRA2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TXNDC17Q9BRA2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TXNDC17Q9BRA2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TXNDC17Q9BRA2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TXNDC17Q9BRA2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TXNDC17Q9BRA2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TXNDC17Q9BRA2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TXNDC17Q9BRA2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TXNDC17Q9BRA2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TXNDC17Q9BRA2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TXNDC17Q9BRA2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TXNDC17Q9BRA2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TXNDC17Q9BRA2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TXNDC17Q9BRA2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TXNDC17Q9BRA2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TXNDC17Q9BRA2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TXNDC17Q9BRA2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TXNDC17Q9BRA2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TXNDC17Q9BRA2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TXNDC17Q9BRA2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TXNDC17Q9BRA2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TXNDC17Q9BRA2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TXNDC17Q9BRA2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TXNDC17Q9BRA2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TXNDC17Q9BRA2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TXNDC17Q9BRA2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TXNDC17Q9BRA2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TXNDC17Q9BRA2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TXNDC17Q9BRA2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TXNDC17Q9BRA2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TXNDC17Q9BRA2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TXNDC17Q9BRA2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TXNDC17Q9BRA2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TXNDC17Q9BRA2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TXNDC17Q9BRA2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TXNDC17Q9BRA2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TXNDC17Q9BRA2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TXNDC17Q9BRA2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TXNDC17Q9BRA2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TXNDC17Q9BRA2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TXNDC17Q9BRA2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TXNDC17Q9BRA2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TXNDC17Q9BRA2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TXNDC17Q9BRA2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TXNDC17Q9BRA2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TXNDC17Q9BRA2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TXNDC17Q9BRA2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TXNDC17Q9BRA2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TXNDC17Q9BRA2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TXNDC17Q9BRA2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
TXNDC17Q9BRA2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TXNDC17Q9BRA2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TXNDC17Q9BRA2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TXNDC17Q9BRA2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TXNDC17Q9BRA2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TXNDC17Q9BRA2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TXNDC17Q9BRA2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TXNDC17Q9BRA2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TXNDC17Q9BRA2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TXNDC17Q9BRA2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TXNDC17Q9BRA2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TXNDC17Q9BRA2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TXNDC17Q9BRA2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TXNDC17Q9BRA2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TXNDC17Q9BRA2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TXNDC17Q9BRA2 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TXNDC17Q9BRA2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TXNDC17Q9BRA2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TXNDC17Q9BRA2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TXNDC17Q9BRA2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TXNDC17Q9BRA2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TXNDC17Q9BRA2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TXNDC17Q9BRA2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TXNDC17Q9BRA2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TXNDC17Q9BRA2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TXNDC17Q9BRA2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TXNDC17Q9BRA2 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TXNDC17Q9BRA2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TXNDC17Q9BRA2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TXNDC17Q9BRA2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TXNDC17Q9BRA2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TXNDC17Q9BRA2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TXNDC17Q9BRA2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TXNDC17Q9BRA2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TXNDC17Q9BRA2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms