Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ04

RBM4B, RNA-binding protein 4B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM4BQ9BQ04 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RBM4BQ9BQ04 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RBM4BQ9BQ04 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RBM4BQ9BQ04 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RBM4BQ9BQ04 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RBM4BQ9BQ04 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RBM4BQ9BQ04 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RBM4BQ9BQ04 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RBM4BQ9BQ04 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RBM4BQ9BQ04 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RBM4BQ9BQ04 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RBM4BQ9BQ04 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RBM4BQ9BQ04 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RBM4BQ9BQ04 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RBM4BQ9BQ04 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RBM4BQ9BQ04 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RBM4BQ9BQ04 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RBM4BQ9BQ04 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RBM4BQ9BQ04 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RBM4BQ9BQ04 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
RBM4BQ9BQ04 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RBM4BQ9BQ04 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RBM4BQ9BQ04 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RBM4BQ9BQ04 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RBM4BQ9BQ04 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RBM4BQ9BQ04 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RBM4BQ9BQ04 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RBM4BQ9BQ04 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RBM4BQ9BQ04 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RBM4BQ9BQ04 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RBM4BQ9BQ04 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RBM4BQ9BQ04 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RBM4BQ9BQ04 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RBM4BQ9BQ04 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RBM4BQ9BQ04 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RBM4BQ9BQ04 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RBM4BQ9BQ04 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RBM4BQ9BQ04 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RBM4BQ9BQ04 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RBM4BQ9BQ04 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RBM4BQ9BQ04 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RBM4BQ9BQ04 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RBM4BQ9BQ04 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RBM4BQ9BQ04 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RBM4BQ9BQ04 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RBM4BQ9BQ04 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RBM4BQ9BQ04 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RBM4BQ9BQ04 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RBM4BQ9BQ04 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RBM4BQ9BQ04 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RBM4BQ9BQ04 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RBM4BQ9BQ04 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RBM4BQ9BQ04 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RBM4BQ9BQ04 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RBM4BQ9BQ04 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RBM4BQ9BQ04 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RBM4BQ9BQ04 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RBM4BQ9BQ04 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RBM4BQ9BQ04 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RBM4BQ9BQ04 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RBM4BQ9BQ04 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RBM4BQ9BQ04 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RBM4BQ9BQ04 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RBM4BQ9BQ04 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RBM4BQ9BQ04 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RBM4BQ9BQ04 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RBM4BQ9BQ04 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RBM4BQ9BQ04 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RBM4BQ9BQ04 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RBM4BQ9BQ04 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RBM4BQ9BQ04 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RBM4BQ9BQ04 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RBM4BQ9BQ04 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RBM4BQ9BQ04 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RBM4BQ9BQ04 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RBM4BQ9BQ04 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RBM4BQ9BQ04 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RBM4BQ9BQ04 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RBM4BQ9BQ04 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RBM4BQ9BQ04 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RBM4BQ9BQ04 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RBM4BQ9BQ04 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RBM4BQ9BQ04 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RBM4BQ9BQ04 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RBM4BQ9BQ04 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RBM4BQ9BQ04 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RBM4BQ9BQ04 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RBM4BQ9BQ04 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RBM4BQ9BQ04 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RBM4BQ9BQ04 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RBM4BQ9BQ04 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RBM4BQ9BQ04 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RBM4BQ9BQ04 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RBM4BQ9BQ04 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RBM4BQ9BQ04 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RBM4BQ9BQ04 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RBM4BQ9BQ04 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RBM4BQ9BQ04 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RBM4BQ9BQ04 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RBM4BQ9BQ04 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms