Protein–RNA interactions for Protein: Q99959

PKP2, Plakophilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP2Q99959 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKP2Q99959 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKP2Q99959 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKP2Q99959 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PKP2Q99959 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKP2Q99959 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKP2Q99959 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKP2Q99959 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKP2Q99959 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKP2Q99959 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKP2Q99959 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKP2Q99959 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PKP2Q99959 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKP2Q99959 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKP2Q99959 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PKP2Q99959 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PKP2Q99959 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PKP2Q99959 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PKP2Q99959 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PKP2Q99959 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PKP2Q99959 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PKP2Q99959 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PKP2Q99959 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PKP2Q99959 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PKP2Q99959 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PKP2Q99959 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PKP2Q99959 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PKP2Q99959 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKP2Q99959 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKP2Q99959 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKP2Q99959 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKP2Q99959 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKP2Q99959 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKP2Q99959 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKP2Q99959 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKP2Q99959 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKP2Q99959 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKP2Q99959 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKP2Q99959 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKP2Q99959 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PKP2Q99959 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PKP2Q99959 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PKP2Q99959 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PKP2Q99959 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PKP2Q99959 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PKP2Q99959 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PKP2Q99959 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PKP2Q99959 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PKP2Q99959 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PKP2Q99959 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKP2Q99959 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKP2Q99959 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKP2Q99959 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKP2Q99959 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKP2Q99959 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKP2Q99959 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKP2Q99959 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKP2Q99959 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKP2Q99959 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKP2Q99959 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKP2Q99959 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKP2Q99959 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKP2Q99959 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PKP2Q99959 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PKP2Q99959 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PKP2Q99959 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PKP2Q99959 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PKP2Q99959 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PKP2Q99959 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PKP2Q99959 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PKP2Q99959 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PKP2Q99959 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PKP2Q99959 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PKP2Q99959 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PKP2Q99959 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PKP2Q99959 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PKP2Q99959 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PKP2Q99959 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PKP2Q99959 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PKP2Q99959 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PKP2Q99959 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PKP2Q99959 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PKP2Q99959 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PKP2Q99959 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PKP2Q99959 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PKP2Q99959 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PKP2Q99959 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PKP2Q99959 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PKP2Q99959 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PKP2Q99959 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PKP2Q99959 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PKP2Q99959 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PKP2Q99959 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PKP2Q99959 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PKP2Q99959 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PKP2Q99959 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PKP2Q99959 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PKP2Q99959 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PKP2Q99959 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PKP2Q99959 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms