Protein–RNA interactions for Protein: Q99946

PRRT1, Proline-rich transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT1Q99946 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PRRT1Q99946 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PRRT1Q99946 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PRRT1Q99946 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PRRT1Q99946 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PRRT1Q99946 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PRRT1Q99946 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PRRT1Q99946 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PRRT1Q99946 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PRRT1Q99946 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PRRT1Q99946 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PRRT1Q99946 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PRRT1Q99946 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PRRT1Q99946 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PRRT1Q99946 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PRRT1Q99946 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PRRT1Q99946 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PRRT1Q99946 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PRRT1Q99946 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PRRT1Q99946 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PRRT1Q99946 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PRRT1Q99946 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PRRT1Q99946 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PRRT1Q99946 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PRRT1Q99946 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PRRT1Q99946 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PRRT1Q99946 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PRRT1Q99946 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PRRT1Q99946 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PRRT1Q99946 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PRRT1Q99946 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PRRT1Q99946 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PRRT1Q99946 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PRRT1Q99946 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PRRT1Q99946 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PRRT1Q99946 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PRRT1Q99946 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PRRT1Q99946 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PRRT1Q99946 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PRRT1Q99946 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PRRT1Q99946 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PRRT1Q99946 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PRRT1Q99946 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PRRT1Q99946 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PRRT1Q99946 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PRRT1Q99946 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PRRT1Q99946 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PRRT1Q99946 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PRRT1Q99946 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PRRT1Q99946 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PRRT1Q99946 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PRRT1Q99946 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PRRT1Q99946 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PRRT1Q99946 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PRRT1Q99946 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PRRT1Q99946 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PRRT1Q99946 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PRRT1Q99946 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PRRT1Q99946 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PRRT1Q99946 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PRRT1Q99946 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PRRT1Q99946 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PRRT1Q99946 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PRRT1Q99946 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PRRT1Q99946 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PRRT1Q99946 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PRRT1Q99946 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PRRT1Q99946 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PRRT1Q99946 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PRRT1Q99946 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PRRT1Q99946 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PRRT1Q99946 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PRRT1Q99946 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PRRT1Q99946 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PRRT1Q99946 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PRRT1Q99946 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PRRT1Q99946 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PRRT1Q99946 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PRRT1Q99946 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PRRT1Q99946 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PRRT1Q99946 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PRRT1Q99946 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PRRT1Q99946 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PRRT1Q99946 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PRRT1Q99946 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PRRT1Q99946 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PRRT1Q99946 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PRRT1Q99946 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PRRT1Q99946 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PRRT1Q99946 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PRRT1Q99946 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PRRT1Q99946 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PRRT1Q99946 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PRRT1Q99946 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PRRT1Q99946 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PRRT1Q99946 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PRRT1Q99946 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PRRT1Q99946 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PRRT1Q99946 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PRRT1Q99946 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms