Protein–RNA interactions for Protein: Q99856

ARID3A, AT-rich interactive domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3AQ99856 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ARID3AQ99856 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARID3AQ99856 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARID3AQ99856 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARID3AQ99856 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
ARID3AQ99856 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARID3AQ99856 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARID3AQ99856 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARID3AQ99856 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARID3AQ99856 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARID3AQ99856 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARID3AQ99856 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ARID3AQ99856 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARID3AQ99856 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARID3AQ99856 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARID3AQ99856 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARID3AQ99856 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARID3AQ99856 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARID3AQ99856 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARID3AQ99856 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARID3AQ99856 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARID3AQ99856 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARID3AQ99856 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARID3AQ99856 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARID3AQ99856 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARID3AQ99856 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARID3AQ99856 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARID3AQ99856 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARID3AQ99856 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARID3AQ99856 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARID3AQ99856 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARID3AQ99856 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARID3AQ99856 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARID3AQ99856 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARID3AQ99856 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARID3AQ99856 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARID3AQ99856 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
ARID3AQ99856 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARID3AQ99856 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARID3AQ99856 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARID3AQ99856 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARID3AQ99856 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARID3AQ99856 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARID3AQ99856 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARID3AQ99856 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ARID3AQ99856 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ARID3AQ99856 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ARID3AQ99856 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ARID3AQ99856 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ARID3AQ99856 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARID3AQ99856 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARID3AQ99856 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARID3AQ99856 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARID3AQ99856 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARID3AQ99856 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARID3AQ99856 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARID3AQ99856 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARID3AQ99856 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARID3AQ99856 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARID3AQ99856 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARID3AQ99856 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARID3AQ99856 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARID3AQ99856 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ARID3AQ99856 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARID3AQ99856 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARID3AQ99856 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARID3AQ99856 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARID3AQ99856 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARID3AQ99856 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARID3AQ99856 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARID3AQ99856 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARID3AQ99856 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARID3AQ99856 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARID3AQ99856 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARID3AQ99856 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARID3AQ99856 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARID3AQ99856 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARID3AQ99856 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARID3AQ99856 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARID3AQ99856 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARID3AQ99856 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARID3AQ99856 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARID3AQ99856 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARID3AQ99856 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARID3AQ99856 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARID3AQ99856 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARID3AQ99856 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARID3AQ99856 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARID3AQ99856 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARID3AQ99856 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARID3AQ99856 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARID3AQ99856 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARID3AQ99856 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARID3AQ99856 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARID3AQ99856 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARID3AQ99856 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARID3AQ99856 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARID3AQ99856 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ARID3AQ99856 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ARID3AQ99856 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms