Protein–RNA interactions for Protein: Q99805

TM9SF2, Transmembrane 9 superfamily member 2, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM9SF2Q99805 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TM9SF2Q99805 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TM9SF2Q99805 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TM9SF2Q99805 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TM9SF2Q99805 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TM9SF2Q99805 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TM9SF2Q99805 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TM9SF2Q99805 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TM9SF2Q99805 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TM9SF2Q99805 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TM9SF2Q99805 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TM9SF2Q99805 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TM9SF2Q99805 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TM9SF2Q99805 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TM9SF2Q99805 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TM9SF2Q99805 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TM9SF2Q99805 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TM9SF2Q99805 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TM9SF2Q99805 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TM9SF2Q99805 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TM9SF2Q99805 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TM9SF2Q99805 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TM9SF2Q99805 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TM9SF2Q99805 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TM9SF2Q99805 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TM9SF2Q99805 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TM9SF2Q99805 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TM9SF2Q99805 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TM9SF2Q99805 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TM9SF2Q99805 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TM9SF2Q99805 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TM9SF2Q99805 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TM9SF2Q99805 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TM9SF2Q99805 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TM9SF2Q99805 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TM9SF2Q99805 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TM9SF2Q99805 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TM9SF2Q99805 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TM9SF2Q99805 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TM9SF2Q99805 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TM9SF2Q99805 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TM9SF2Q99805 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TM9SF2Q99805 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TM9SF2Q99805 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TM9SF2Q99805 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TM9SF2Q99805 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TM9SF2Q99805 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TM9SF2Q99805 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TM9SF2Q99805 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TM9SF2Q99805 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TM9SF2Q99805 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TM9SF2Q99805 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TM9SF2Q99805 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TM9SF2Q99805 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TM9SF2Q99805 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TM9SF2Q99805 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TM9SF2Q99805 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TM9SF2Q99805 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TM9SF2Q99805 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TM9SF2Q99805 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TM9SF2Q99805 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TM9SF2Q99805 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TM9SF2Q99805 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TM9SF2Q99805 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TM9SF2Q99805 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TM9SF2Q99805 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TM9SF2Q99805 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TM9SF2Q99805 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TM9SF2Q99805 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TM9SF2Q99805 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TM9SF2Q99805 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TM9SF2Q99805 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TM9SF2Q99805 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TM9SF2Q99805 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TM9SF2Q99805 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TM9SF2Q99805 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TM9SF2Q99805 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TM9SF2Q99805 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TM9SF2Q99805 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TM9SF2Q99805 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TM9SF2Q99805 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TM9SF2Q99805 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TM9SF2Q99805 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TM9SF2Q99805 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TM9SF2Q99805 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TM9SF2Q99805 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TM9SF2Q99805 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TM9SF2Q99805 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TM9SF2Q99805 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TM9SF2Q99805 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TM9SF2Q99805 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TM9SF2Q99805 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TM9SF2Q99805 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TM9SF2Q99805 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TM9SF2Q99805 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TM9SF2Q99805 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TM9SF2Q99805 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TM9SF2Q99805 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TM9SF2Q99805 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TM9SF2Q99805 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms