Protein–RNA interactions for Protein: Q99743

NPAS2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS2Q99743 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPAS2Q99743 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPAS2Q99743 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NPAS2Q99743 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPAS2Q99743 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPAS2Q99743 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPAS2Q99743 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPAS2Q99743 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPAS2Q99743 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NPAS2Q99743 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NPAS2Q99743 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NPAS2Q99743 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NPAS2Q99743 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NPAS2Q99743 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NPAS2Q99743 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NPAS2Q99743 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NPAS2Q99743 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPAS2Q99743 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPAS2Q99743 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPAS2Q99743 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPAS2Q99743 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPAS2Q99743 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPAS2Q99743 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPAS2Q99743 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPAS2Q99743 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPAS2Q99743 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPAS2Q99743 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPAS2Q99743 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NPAS2Q99743 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPAS2Q99743 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NPAS2Q99743 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NPAS2Q99743 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPAS2Q99743 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPAS2Q99743 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPAS2Q99743 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NPAS2Q99743 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPAS2Q99743 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPAS2Q99743 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NPAS2Q99743 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPAS2Q99743 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPAS2Q99743 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPAS2Q99743 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPAS2Q99743 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPAS2Q99743 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPAS2Q99743 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPAS2Q99743 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPAS2Q99743 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NPAS2Q99743 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPAS2Q99743 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPAS2Q99743 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPAS2Q99743 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPAS2Q99743 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPAS2Q99743 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NPAS2Q99743 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPAS2Q99743 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPAS2Q99743 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPAS2Q99743 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPAS2Q99743 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NPAS2Q99743 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPAS2Q99743 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPAS2Q99743 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPAS2Q99743 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NPAS2Q99743 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPAS2Q99743 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPAS2Q99743 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPAS2Q99743 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPAS2Q99743 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPAS2Q99743 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPAS2Q99743 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NPAS2Q99743 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPAS2Q99743 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPAS2Q99743 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPAS2Q99743 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPAS2Q99743 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPAS2Q99743 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NPAS2Q99743 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NPAS2Q99743 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPAS2Q99743 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPAS2Q99743 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NPAS2Q99743 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPAS2Q99743 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPAS2Q99743 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPAS2Q99743 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPAS2Q99743 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPAS2Q99743 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPAS2Q99743 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPAS2Q99743 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPAS2Q99743 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPAS2Q99743 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPAS2Q99743 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPAS2Q99743 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPAS2Q99743 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NPAS2Q99743 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NPAS2Q99743 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPAS2Q99743 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPAS2Q99743 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPAS2Q99743 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPAS2Q99743 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPAS2Q99743 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPAS2Q99743 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms