Protein–RNA interactions for Protein: Q99698

LYST, Lysosomal-trafficking regulator, humanhuman

Predictions only

Length 3,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSTQ99698 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LYSTQ99698 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LYSTQ99698 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LYSTQ99698 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LYSTQ99698 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LYSTQ99698 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LYSTQ99698 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LYSTQ99698 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LYSTQ99698 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LYSTQ99698 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LYSTQ99698 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LYSTQ99698 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LYSTQ99698 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LYSTQ99698 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LYSTQ99698 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LYSTQ99698 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LYSTQ99698 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LYSTQ99698 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LYSTQ99698 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LYSTQ99698 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LYSTQ99698 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LYSTQ99698 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LYSTQ99698 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LYSTQ99698 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LYSTQ99698 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LYSTQ99698 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LYSTQ99698 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LYSTQ99698 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LYSTQ99698 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LYSTQ99698 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LYSTQ99698 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LYSTQ99698 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LYSTQ99698 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LYSTQ99698 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LYSTQ99698 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LYSTQ99698 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LYSTQ99698 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LYSTQ99698 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LYSTQ99698 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LYSTQ99698 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LYSTQ99698 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LYSTQ99698 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LYSTQ99698 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LYSTQ99698 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LYSTQ99698 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LYSTQ99698 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LYSTQ99698 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LYSTQ99698 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LYSTQ99698 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LYSTQ99698 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LYSTQ99698 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LYSTQ99698 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LYSTQ99698 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
LYSTQ99698 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
LYSTQ99698 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LYSTQ99698 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LYSTQ99698 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LYSTQ99698 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LYSTQ99698 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LYSTQ99698 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LYSTQ99698 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LYSTQ99698 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LYSTQ99698 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LYSTQ99698 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LYSTQ99698 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LYSTQ99698 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LYSTQ99698 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LYSTQ99698 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LYSTQ99698 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LYSTQ99698 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LYSTQ99698 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LYSTQ99698 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LYSTQ99698 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LYSTQ99698 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LYSTQ99698 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LYSTQ99698 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LYSTQ99698 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LYSTQ99698 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LYSTQ99698 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LYSTQ99698 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LYSTQ99698 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LYSTQ99698 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LYSTQ99698 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LYSTQ99698 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LYSTQ99698 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LYSTQ99698 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LYSTQ99698 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LYSTQ99698 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LYSTQ99698 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LYSTQ99698 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LYSTQ99698 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LYSTQ99698 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LYSTQ99698 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LYSTQ99698 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LYSTQ99698 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LYSTQ99698 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LYSTQ99698 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LYSTQ99698 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LYSTQ99698 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LYSTQ99698 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms