Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PITX2Q99697 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PITX2Q99697 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PITX2Q99697 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PITX2Q99697 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PITX2Q99697 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PITX2Q99697 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PITX2Q99697 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PITX2Q99697 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PITX2Q99697 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PITX2Q99697 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PITX2Q99697 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PITX2Q99697 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PITX2Q99697 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PITX2Q99697 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PITX2Q99697 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PITX2Q99697 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PITX2Q99697 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PITX2Q99697 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PITX2Q99697 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PITX2Q99697 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PITX2Q99697 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PITX2Q99697 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PITX2Q99697 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PITX2Q99697 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PITX2Q99697 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PITX2Q99697 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PITX2Q99697 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PITX2Q99697 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PITX2Q99697 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PITX2Q99697 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PITX2Q99697 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PITX2Q99697 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PITX2Q99697 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PITX2Q99697 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PITX2Q99697 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PITX2Q99697 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PITX2Q99697 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PITX2Q99697 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PITX2Q99697 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PITX2Q99697 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PITX2Q99697 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PITX2Q99697 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PITX2Q99697 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PITX2Q99697 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PITX2Q99697 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PITX2Q99697 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PITX2Q99697 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PITX2Q99697 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PITX2Q99697 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PITX2Q99697 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PITX2Q99697 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PITX2Q99697 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PITX2Q99697 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PITX2Q99697 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PITX2Q99697 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PITX2Q99697 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PITX2Q99697 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PITX2Q99697 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PITX2Q99697 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PITX2Q99697 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PITX2Q99697 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PITX2Q99697 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PITX2Q99697 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PITX2Q99697 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PITX2Q99697 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PITX2Q99697 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PITX2Q99697 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PITX2Q99697 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PITX2Q99697 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PITX2Q99697 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PITX2Q99697 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PITX2Q99697 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PITX2Q99697 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PITX2Q99697 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PITX2Q99697 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PITX2Q99697 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PITX2Q99697 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PITX2Q99697 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PITX2Q99697 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PITX2Q99697 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PITX2Q99697 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PITX2Q99697 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PITX2Q99697 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PITX2Q99697 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PITX2Q99697 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PITX2Q99697 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PITX2Q99697 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PITX2Q99697 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PITX2Q99697 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PITX2Q99697 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PITX2Q99697 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PITX2Q99697 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PITX2Q99697 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PITX2Q99697 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PITX2Q99697 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PITX2Q99697 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PITX2Q99697 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PITX2Q99697 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PITX2Q99697 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms