Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
MEIS3Q99687 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
MEIS3Q99687 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
MEIS3Q99687 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
MEIS3Q99687 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
MEIS3Q99687 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
MEIS3Q99687 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
MEIS3Q99687 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
MEIS3Q99687 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
MEIS3Q99687 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
MEIS3Q99687 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
MEIS3Q99687 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
MEIS3Q99687 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
MEIS3Q99687 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
MEIS3Q99687 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
MEIS3Q99687 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
MEIS3Q99687 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
MEIS3Q99687 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
MEIS3Q99687 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
MEIS3Q99687 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
MEIS3Q99687 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
MEIS3Q99687 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
MEIS3Q99687 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
MEIS3Q99687 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
MEIS3Q99687 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
MEIS3Q99687 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
MEIS3Q99687 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
MEIS3Q99687 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
MEIS3Q99687 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
MEIS3Q99687 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
MEIS3Q99687 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
MEIS3Q99687 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
MEIS3Q99687 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
MEIS3Q99687 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
MEIS3Q99687 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
MEIS3Q99687 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
MEIS3Q99687 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
MEIS3Q99687 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
MEIS3Q99687 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
MEIS3Q99687 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
MEIS3Q99687 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
MEIS3Q99687 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
MEIS3Q99687 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
MEIS3Q99687 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
MEIS3Q99687 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
MEIS3Q99687 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
MEIS3Q99687 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
MEIS3Q99687 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
MEIS3Q99687 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
MEIS3Q99687 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
MEIS3Q99687 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
MEIS3Q99687 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
MEIS3Q99687 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
MEIS3Q99687 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
MEIS3Q99687 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
MEIS3Q99687 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
MEIS3Q99687 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
MEIS3Q99687 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
MEIS3Q99687 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
MEIS3Q99687 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
MEIS3Q99687 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
MEIS3Q99687 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
MEIS3Q99687 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
MEIS3Q99687 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
MEIS3Q99687 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
MEIS3Q99687 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
MEIS3Q99687 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
MEIS3Q99687 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
MEIS3Q99687 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
MEIS3Q99687 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
MEIS3Q99687 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
MEIS3Q99687 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
MEIS3Q99687 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
MEIS3Q99687 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
MEIS3Q99687 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
MEIS3Q99687 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
MEIS3Q99687 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
MEIS3Q99687 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
MEIS3Q99687 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MEIS3Q99687 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MEIS3Q99687 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MEIS3Q99687 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
MEIS3Q99687 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
MEIS3Q99687 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
MEIS3Q99687 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
MEIS3Q99687 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
MEIS3Q99687 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
MEIS3Q99687 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MEIS3Q99687 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MEIS3Q99687 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
MEIS3Q99687 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
MEIS3Q99687 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
MEIS3Q99687 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
MEIS3Q99687 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
MEIS3Q99687 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
MEIS3Q99687 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
MEIS3Q99687 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
MEIS3Q99687 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
MEIS3Q99687 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
MEIS3Q99687 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms