Protein–RNA interactions for Protein: Q99542

MMP19, Matrix metalloproteinase-19, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP19Q99542 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
MMP19Q99542 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MMP19Q99542 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MMP19Q99542 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MMP19Q99542 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MMP19Q99542 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MMP19Q99542 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MMP19Q99542 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MMP19Q99542 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MMP19Q99542 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MMP19Q99542 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MMP19Q99542 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MMP19Q99542 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MMP19Q99542 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MMP19Q99542 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MMP19Q99542 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MMP19Q99542 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MMP19Q99542 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MMP19Q99542 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MMP19Q99542 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MMP19Q99542 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MMP19Q99542 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MMP19Q99542 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
MMP19Q99542 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MMP19Q99542 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MMP19Q99542 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MMP19Q99542 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MMP19Q99542 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MMP19Q99542 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MMP19Q99542 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MMP19Q99542 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MMP19Q99542 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MMP19Q99542 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
MMP19Q99542 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MMP19Q99542 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MMP19Q99542 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MMP19Q99542 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
MMP19Q99542 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
MMP19Q99542 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MMP19Q99542 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MMP19Q99542 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MMP19Q99542 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MMP19Q99542 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MMP19Q99542 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MMP19Q99542 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MMP19Q99542 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MMP19Q99542 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MMP19Q99542 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MMP19Q99542 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MMP19Q99542 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MMP19Q99542 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MMP19Q99542 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MMP19Q99542 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MMP19Q99542 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MMP19Q99542 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MMP19Q99542 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MMP19Q99542 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MMP19Q99542 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MMP19Q99542 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MMP19Q99542 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
MMP19Q99542 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MMP19Q99542 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
MMP19Q99542 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
MMP19Q99542 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
MMP19Q99542 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
MMP19Q99542 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MMP19Q99542 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MMP19Q99542 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MMP19Q99542 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MMP19Q99542 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MMP19Q99542 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MMP19Q99542 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MMP19Q99542 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MMP19Q99542 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MMP19Q99542 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MMP19Q99542 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MMP19Q99542 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MMP19Q99542 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MMP19Q99542 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MMP19Q99542 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MMP19Q99542 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MMP19Q99542 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MMP19Q99542 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MMP19Q99542 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MMP19Q99542 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MMP19Q99542 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MMP19Q99542 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
MMP19Q99542 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
MMP19Q99542 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MMP19Q99542 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MMP19Q99542 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MMP19Q99542 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MMP19Q99542 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
MMP19Q99542 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
MMP19Q99542 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
MMP19Q99542 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
MMP19Q99542 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
MMP19Q99542 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MMP19Q99542 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MMP19Q99542 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 249 ms