Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY5

CRAMP1, Protein cramped-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRAMP1Q96RY5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CRAMP1Q96RY5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CRAMP1Q96RY5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CRAMP1Q96RY5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CRAMP1Q96RY5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CRAMP1Q96RY5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CRAMP1Q96RY5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CRAMP1Q96RY5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CRAMP1Q96RY5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CRAMP1Q96RY5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CRAMP1Q96RY5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CRAMP1Q96RY5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CRAMP1Q96RY5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CRAMP1Q96RY5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CRAMP1Q96RY5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CRAMP1Q96RY5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CRAMP1Q96RY5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CRAMP1Q96RY5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CRAMP1Q96RY5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CRAMP1Q96RY5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CRAMP1Q96RY5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CRAMP1Q96RY5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CRAMP1Q96RY5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CRAMP1Q96RY5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CRAMP1Q96RY5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CRAMP1Q96RY5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CRAMP1Q96RY5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CRAMP1Q96RY5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CRAMP1Q96RY5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CRAMP1Q96RY5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CRAMP1Q96RY5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CRAMP1Q96RY5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CRAMP1Q96RY5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CRAMP1Q96RY5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CRAMP1Q96RY5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CRAMP1Q96RY5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CRAMP1Q96RY5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CRAMP1Q96RY5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CRAMP1Q96RY5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CRAMP1Q96RY5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CRAMP1Q96RY5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CRAMP1Q96RY5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CRAMP1Q96RY5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CRAMP1Q96RY5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CRAMP1Q96RY5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CRAMP1Q96RY5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CRAMP1Q96RY5 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CRAMP1Q96RY5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CRAMP1Q96RY5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CRAMP1Q96RY5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CRAMP1Q96RY5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CRAMP1Q96RY5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CRAMP1Q96RY5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CRAMP1Q96RY5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CRAMP1Q96RY5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CRAMP1Q96RY5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CRAMP1Q96RY5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CRAMP1Q96RY5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CRAMP1Q96RY5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CRAMP1Q96RY5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CRAMP1Q96RY5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CRAMP1Q96RY5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CRAMP1Q96RY5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CRAMP1Q96RY5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CRAMP1Q96RY5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CRAMP1Q96RY5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CRAMP1Q96RY5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CRAMP1Q96RY5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CRAMP1Q96RY5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CRAMP1Q96RY5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CRAMP1Q96RY5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CRAMP1Q96RY5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CRAMP1Q96RY5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CRAMP1Q96RY5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CRAMP1Q96RY5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CRAMP1Q96RY5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CRAMP1Q96RY5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CRAMP1Q96RY5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CRAMP1Q96RY5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CRAMP1Q96RY5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CRAMP1Q96RY5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CRAMP1Q96RY5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CRAMP1Q96RY5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CRAMP1Q96RY5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CRAMP1Q96RY5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
CRAMP1Q96RY5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CRAMP1Q96RY5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
CRAMP1Q96RY5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CRAMP1Q96RY5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CRAMP1Q96RY5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CRAMP1Q96RY5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CRAMP1Q96RY5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CRAMP1Q96RY5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CRAMP1Q96RY5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CRAMP1Q96RY5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CRAMP1Q96RY5 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CRAMP1Q96RY5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CRAMP1Q96RY5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CRAMP1Q96RY5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CRAMP1Q96RY5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms