Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD5

DEPDC7, DEP domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPDC7Q96QD5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DEPDC7Q96QD5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DEPDC7Q96QD5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DEPDC7Q96QD5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DEPDC7Q96QD5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DEPDC7Q96QD5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DEPDC7Q96QD5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DEPDC7Q96QD5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DEPDC7Q96QD5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
DEPDC7Q96QD5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DEPDC7Q96QD5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DEPDC7Q96QD5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DEPDC7Q96QD5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DEPDC7Q96QD5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DEPDC7Q96QD5 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DEPDC7Q96QD5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DEPDC7Q96QD5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
DEPDC7Q96QD5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DEPDC7Q96QD5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
DEPDC7Q96QD5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DEPDC7Q96QD5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DEPDC7Q96QD5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DEPDC7Q96QD5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DEPDC7Q96QD5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DEPDC7Q96QD5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DEPDC7Q96QD5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DEPDC7Q96QD5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DEPDC7Q96QD5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DEPDC7Q96QD5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DEPDC7Q96QD5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DEPDC7Q96QD5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DEPDC7Q96QD5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DEPDC7Q96QD5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DEPDC7Q96QD5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DEPDC7Q96QD5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
DEPDC7Q96QD5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DEPDC7Q96QD5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DEPDC7Q96QD5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DEPDC7Q96QD5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DEPDC7Q96QD5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DEPDC7Q96QD5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DEPDC7Q96QD5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DEPDC7Q96QD5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DEPDC7Q96QD5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DEPDC7Q96QD5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DEPDC7Q96QD5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DEPDC7Q96QD5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DEPDC7Q96QD5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DEPDC7Q96QD5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DEPDC7Q96QD5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DEPDC7Q96QD5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DEPDC7Q96QD5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DEPDC7Q96QD5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DEPDC7Q96QD5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DEPDC7Q96QD5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DEPDC7Q96QD5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DEPDC7Q96QD5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DEPDC7Q96QD5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DEPDC7Q96QD5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DEPDC7Q96QD5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DEPDC7Q96QD5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DEPDC7Q96QD5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DEPDC7Q96QD5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DEPDC7Q96QD5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DEPDC7Q96QD5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DEPDC7Q96QD5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DEPDC7Q96QD5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DEPDC7Q96QD5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DEPDC7Q96QD5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DEPDC7Q96QD5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DEPDC7Q96QD5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DEPDC7Q96QD5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DEPDC7Q96QD5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DEPDC7Q96QD5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DEPDC7Q96QD5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DEPDC7Q96QD5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DEPDC7Q96QD5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DEPDC7Q96QD5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DEPDC7Q96QD5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
DEPDC7Q96QD5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DEPDC7Q96QD5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DEPDC7Q96QD5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DEPDC7Q96QD5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DEPDC7Q96QD5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DEPDC7Q96QD5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DEPDC7Q96QD5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DEPDC7Q96QD5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DEPDC7Q96QD5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
DEPDC7Q96QD5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DEPDC7Q96QD5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DEPDC7Q96QD5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DEPDC7Q96QD5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DEPDC7Q96QD5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DEPDC7Q96QD5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DEPDC7Q96QD5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DEPDC7Q96QD5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DEPDC7Q96QD5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DEPDC7Q96QD5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DEPDC7Q96QD5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DEPDC7Q96QD5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms