Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q11

TRNT1, CCA tRNA nucleotidyltransferase 1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 434 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNT1Q96Q11 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRNT1Q96Q11 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRNT1Q96Q11 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRNT1Q96Q11 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRNT1Q96Q11 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRNT1Q96Q11 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRNT1Q96Q11 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRNT1Q96Q11 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRNT1Q96Q11 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRNT1Q96Q11 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TRNT1Q96Q11 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRNT1Q96Q11 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRNT1Q96Q11 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRNT1Q96Q11 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRNT1Q96Q11 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRNT1Q96Q11 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRNT1Q96Q11 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRNT1Q96Q11 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRNT1Q96Q11 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRNT1Q96Q11 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRNT1Q96Q11 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRNT1Q96Q11 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRNT1Q96Q11 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRNT1Q96Q11 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRNT1Q96Q11 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRNT1Q96Q11 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRNT1Q96Q11 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRNT1Q96Q11 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRNT1Q96Q11 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRNT1Q96Q11 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRNT1Q96Q11 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRNT1Q96Q11 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRNT1Q96Q11 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRNT1Q96Q11 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRNT1Q96Q11 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRNT1Q96Q11 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRNT1Q96Q11 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRNT1Q96Q11 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRNT1Q96Q11 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRNT1Q96Q11 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRNT1Q96Q11 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRNT1Q96Q11 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRNT1Q96Q11 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRNT1Q96Q11 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRNT1Q96Q11 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRNT1Q96Q11 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRNT1Q96Q11 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRNT1Q96Q11 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRNT1Q96Q11 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRNT1Q96Q11 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRNT1Q96Q11 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRNT1Q96Q11 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRNT1Q96Q11 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRNT1Q96Q11 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRNT1Q96Q11 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRNT1Q96Q11 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRNT1Q96Q11 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRNT1Q96Q11 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRNT1Q96Q11 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRNT1Q96Q11 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TRNT1Q96Q11 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRNT1Q96Q11 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRNT1Q96Q11 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRNT1Q96Q11 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRNT1Q96Q11 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRNT1Q96Q11 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRNT1Q96Q11 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TRNT1Q96Q11 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRNT1Q96Q11 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRNT1Q96Q11 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRNT1Q96Q11 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRNT1Q96Q11 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRNT1Q96Q11 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRNT1Q96Q11 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TRNT1Q96Q11 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRNT1Q96Q11 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRNT1Q96Q11 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRNT1Q96Q11 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRNT1Q96Q11 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRNT1Q96Q11 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRNT1Q96Q11 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRNT1Q96Q11 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRNT1Q96Q11 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TRNT1Q96Q11 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRNT1Q96Q11 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRNT1Q96Q11 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRNT1Q96Q11 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRNT1Q96Q11 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRNT1Q96Q11 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRNT1Q96Q11 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRNT1Q96Q11 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRNT1Q96Q11 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRNT1Q96Q11 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRNT1Q96Q11 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRNT1Q96Q11 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRNT1Q96Q11 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRNT1Q96Q11 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRNT1Q96Q11 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRNT1Q96Q11 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRNT1Q96Q11 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
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