Protein–RNA interactions for Protein: Q96PQ1

SIGLEC12, Sialic acid-binding Ig-like lectin 12, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIGLEC12Q96PQ1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIGLEC12Q96PQ1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIGLEC12Q96PQ1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIGLEC12Q96PQ1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIGLEC12Q96PQ1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SIGLEC12Q96PQ1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SIGLEC12Q96PQ1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SIGLEC12Q96PQ1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SIGLEC12Q96PQ1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SIGLEC12Q96PQ1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SIGLEC12Q96PQ1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SIGLEC12Q96PQ1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SIGLEC12Q96PQ1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SIGLEC12Q96PQ1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SIGLEC12Q96PQ1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SIGLEC12Q96PQ1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SIGLEC12Q96PQ1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SIGLEC12Q96PQ1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SIGLEC12Q96PQ1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SIGLEC12Q96PQ1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIGLEC12Q96PQ1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIGLEC12Q96PQ1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIGLEC12Q96PQ1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIGLEC12Q96PQ1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIGLEC12Q96PQ1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIGLEC12Q96PQ1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIGLEC12Q96PQ1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIGLEC12Q96PQ1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SIGLEC12Q96PQ1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIGLEC12Q96PQ1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIGLEC12Q96PQ1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIGLEC12Q96PQ1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIGLEC12Q96PQ1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIGLEC12Q96PQ1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIGLEC12Q96PQ1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIGLEC12Q96PQ1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SIGLEC12Q96PQ1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SIGLEC12Q96PQ1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SIGLEC12Q96PQ1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SIGLEC12Q96PQ1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SIGLEC12Q96PQ1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SIGLEC12Q96PQ1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SIGLEC12Q96PQ1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SIGLEC12Q96PQ1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SIGLEC12Q96PQ1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SIGLEC12Q96PQ1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SIGLEC12Q96PQ1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SIGLEC12Q96PQ1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SIGLEC12Q96PQ1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SIGLEC12Q96PQ1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SIGLEC12Q96PQ1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIGLEC12Q96PQ1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIGLEC12Q96PQ1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIGLEC12Q96PQ1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SIGLEC12Q96PQ1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIGLEC12Q96PQ1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIGLEC12Q96PQ1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIGLEC12Q96PQ1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIGLEC12Q96PQ1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SIGLEC12Q96PQ1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIGLEC12Q96PQ1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIGLEC12Q96PQ1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIGLEC12Q96PQ1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIGLEC12Q96PQ1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIGLEC12Q96PQ1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIGLEC12Q96PQ1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIGLEC12Q96PQ1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIGLEC12Q96PQ1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIGLEC12Q96PQ1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIGLEC12Q96PQ1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIGLEC12Q96PQ1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIGLEC12Q96PQ1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SIGLEC12Q96PQ1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIGLEC12Q96PQ1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIGLEC12Q96PQ1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIGLEC12Q96PQ1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIGLEC12Q96PQ1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIGLEC12Q96PQ1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIGLEC12Q96PQ1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIGLEC12Q96PQ1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIGLEC12Q96PQ1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIGLEC12Q96PQ1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIGLEC12Q96PQ1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIGLEC12Q96PQ1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIGLEC12Q96PQ1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIGLEC12Q96PQ1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIGLEC12Q96PQ1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIGLEC12Q96PQ1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIGLEC12Q96PQ1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIGLEC12Q96PQ1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIGLEC12Q96PQ1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SIGLEC12Q96PQ1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SIGLEC12Q96PQ1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SIGLEC12Q96PQ1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SIGLEC12Q96PQ1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIGLEC12Q96PQ1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIGLEC12Q96PQ1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIGLEC12Q96PQ1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIGLEC12Q96PQ1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIGLEC12Q96PQ1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms