Protein–RNA interactions for Protein: Q96P69

GPR78, G-protein coupled receptor 78, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR78Q96P69 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPR78Q96P69 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPR78Q96P69 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPR78Q96P69 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPR78Q96P69 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPR78Q96P69 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPR78Q96P69 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPR78Q96P69 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPR78Q96P69 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GPR78Q96P69 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPR78Q96P69 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPR78Q96P69 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPR78Q96P69 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GPR78Q96P69 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPR78Q96P69 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPR78Q96P69 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPR78Q96P69 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPR78Q96P69 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GPR78Q96P69 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPR78Q96P69 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPR78Q96P69 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPR78Q96P69 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPR78Q96P69 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPR78Q96P69 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPR78Q96P69 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPR78Q96P69 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPR78Q96P69 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPR78Q96P69 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPR78Q96P69 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPR78Q96P69 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GPR78Q96P69 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPR78Q96P69 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPR78Q96P69 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GPR78Q96P69 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GPR78Q96P69 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GPR78Q96P69 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GPR78Q96P69 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPR78Q96P69 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPR78Q96P69 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPR78Q96P69 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPR78Q96P69 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPR78Q96P69 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPR78Q96P69 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPR78Q96P69 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPR78Q96P69 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPR78Q96P69 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPR78Q96P69 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPR78Q96P69 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPR78Q96P69 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPR78Q96P69 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPR78Q96P69 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPR78Q96P69 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPR78Q96P69 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPR78Q96P69 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPR78Q96P69 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPR78Q96P69 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPR78Q96P69 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPR78Q96P69 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPR78Q96P69 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPR78Q96P69 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPR78Q96P69 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPR78Q96P69 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPR78Q96P69 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPR78Q96P69 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPR78Q96P69 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPR78Q96P69 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPR78Q96P69 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPR78Q96P69 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPR78Q96P69 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPR78Q96P69 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPR78Q96P69 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPR78Q96P69 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPR78Q96P69 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPR78Q96P69 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPR78Q96P69 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPR78Q96P69 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPR78Q96P69 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPR78Q96P69 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPR78Q96P69 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPR78Q96P69 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPR78Q96P69 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GPR78Q96P69 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPR78Q96P69 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPR78Q96P69 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPR78Q96P69 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPR78Q96P69 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPR78Q96P69 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPR78Q96P69 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPR78Q96P69 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPR78Q96P69 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GPR78Q96P69 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPR78Q96P69 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPR78Q96P69 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPR78Q96P69 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPR78Q96P69 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPR78Q96P69 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPR78Q96P69 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPR78Q96P69 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPR78Q96P69 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GPR78Q96P69 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms