Protein–RNA interactions for Protein: Q96P47

AGAP3, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP3Q96P47 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AGAP3Q96P47 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AGAP3Q96P47 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AGAP3Q96P47 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AGAP3Q96P47 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AGAP3Q96P47 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AGAP3Q96P47 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AGAP3Q96P47 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AGAP3Q96P47 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AGAP3Q96P47 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AGAP3Q96P47 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AGAP3Q96P47 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AGAP3Q96P47 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
AGAP3Q96P47 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AGAP3Q96P47 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AGAP3Q96P47 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AGAP3Q96P47 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AGAP3Q96P47 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AGAP3Q96P47 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AGAP3Q96P47 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AGAP3Q96P47 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AGAP3Q96P47 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AGAP3Q96P47 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
AGAP3Q96P47 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AGAP3Q96P47 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AGAP3Q96P47 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AGAP3Q96P47 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
AGAP3Q96P47 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
AGAP3Q96P47 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AGAP3Q96P47 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AGAP3Q96P47 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AGAP3Q96P47 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
AGAP3Q96P47 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AGAP3Q96P47 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
AGAP3Q96P47 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AGAP3Q96P47 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
AGAP3Q96P47 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
AGAP3Q96P47 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
AGAP3Q96P47 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AGAP3Q96P47 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AGAP3Q96P47 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
AGAP3Q96P47 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AGAP3Q96P47 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AGAP3Q96P47 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AGAP3Q96P47 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AGAP3Q96P47 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AGAP3Q96P47 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AGAP3Q96P47 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AGAP3Q96P47 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
AGAP3Q96P47 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AGAP3Q96P47 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AGAP3Q96P47 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AGAP3Q96P47 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AGAP3Q96P47 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AGAP3Q96P47 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AGAP3Q96P47 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AGAP3Q96P47 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AGAP3Q96P47 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AGAP3Q96P47 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
AGAP3Q96P47 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
AGAP3Q96P47 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
AGAP3Q96P47 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AGAP3Q96P47 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AGAP3Q96P47 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
AGAP3Q96P47 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
AGAP3Q96P47 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
AGAP3Q96P47 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AGAP3Q96P47 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
AGAP3Q96P47 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AGAP3Q96P47 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
AGAP3Q96P47 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AGAP3Q96P47 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
AGAP3Q96P47 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
AGAP3Q96P47 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
AGAP3Q96P47 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AGAP3Q96P47 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
AGAP3Q96P47 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
AGAP3Q96P47 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AGAP3Q96P47 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
AGAP3Q96P47 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
AGAP3Q96P47 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AGAP3Q96P47 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AGAP3Q96P47 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AGAP3Q96P47 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AGAP3Q96P47 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AGAP3Q96P47 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
AGAP3Q96P47 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AGAP3Q96P47 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
AGAP3Q96P47 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
AGAP3Q96P47 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
AGAP3Q96P47 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
AGAP3Q96P47 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
AGAP3Q96P47 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
AGAP3Q96P47 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
AGAP3Q96P47 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
AGAP3Q96P47 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
AGAP3Q96P47 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
AGAP3Q96P47 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AGAP3Q96P47 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AGAP3Q96P47 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms