Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK3

FAM20A, Pseudokinase FAM20A, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20AQ96MK3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FAM20AQ96MK3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FAM20AQ96MK3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FAM20AQ96MK3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FAM20AQ96MK3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FAM20AQ96MK3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
FAM20AQ96MK3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FAM20AQ96MK3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FAM20AQ96MK3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FAM20AQ96MK3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FAM20AQ96MK3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
FAM20AQ96MK3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FAM20AQ96MK3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FAM20AQ96MK3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FAM20AQ96MK3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FAM20AQ96MK3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
FAM20AQ96MK3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FAM20AQ96MK3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FAM20AQ96MK3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FAM20AQ96MK3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
FAM20AQ96MK3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FAM20AQ96MK3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FAM20AQ96MK3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FAM20AQ96MK3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FAM20AQ96MK3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FAM20AQ96MK3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FAM20AQ96MK3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FAM20AQ96MK3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
FAM20AQ96MK3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FAM20AQ96MK3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FAM20AQ96MK3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FAM20AQ96MK3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FAM20AQ96MK3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FAM20AQ96MK3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FAM20AQ96MK3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FAM20AQ96MK3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FAM20AQ96MK3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FAM20AQ96MK3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FAM20AQ96MK3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FAM20AQ96MK3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FAM20AQ96MK3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FAM20AQ96MK3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FAM20AQ96MK3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FAM20AQ96MK3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FAM20AQ96MK3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FAM20AQ96MK3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FAM20AQ96MK3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FAM20AQ96MK3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FAM20AQ96MK3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FAM20AQ96MK3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FAM20AQ96MK3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FAM20AQ96MK3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FAM20AQ96MK3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FAM20AQ96MK3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FAM20AQ96MK3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FAM20AQ96MK3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FAM20AQ96MK3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FAM20AQ96MK3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FAM20AQ96MK3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FAM20AQ96MK3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FAM20AQ96MK3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FAM20AQ96MK3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FAM20AQ96MK3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
FAM20AQ96MK3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FAM20AQ96MK3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FAM20AQ96MK3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FAM20AQ96MK3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FAM20AQ96MK3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FAM20AQ96MK3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FAM20AQ96MK3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FAM20AQ96MK3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FAM20AQ96MK3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FAM20AQ96MK3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FAM20AQ96MK3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
FAM20AQ96MK3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FAM20AQ96MK3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FAM20AQ96MK3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FAM20AQ96MK3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FAM20AQ96MK3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FAM20AQ96MK3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FAM20AQ96MK3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FAM20AQ96MK3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
FAM20AQ96MK3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FAM20AQ96MK3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FAM20AQ96MK3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FAM20AQ96MK3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
FAM20AQ96MK3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
FAM20AQ96MK3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FAM20AQ96MK3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FAM20AQ96MK3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FAM20AQ96MK3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FAM20AQ96MK3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FAM20AQ96MK3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FAM20AQ96MK3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FAM20AQ96MK3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
FAM20AQ96MK3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FAM20AQ96MK3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FAM20AQ96MK3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FAM20AQ96MK3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FAM20AQ96MK3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 289.2 ms