Protein–RNA interactions for Protein: Q96M02

C10orf90, Centrosomal protein C10orf90, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf90Q96M02 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C10orf90Q96M02 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C10orf90Q96M02 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C10orf90Q96M02 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C10orf90Q96M02 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C10orf90Q96M02 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C10orf90Q96M02 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C10orf90Q96M02 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C10orf90Q96M02 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C10orf90Q96M02 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C10orf90Q96M02 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C10orf90Q96M02 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C10orf90Q96M02 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C10orf90Q96M02 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C10orf90Q96M02 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C10orf90Q96M02 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C10orf90Q96M02 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C10orf90Q96M02 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C10orf90Q96M02 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C10orf90Q96M02 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C10orf90Q96M02 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C10orf90Q96M02 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C10orf90Q96M02 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C10orf90Q96M02 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
C10orf90Q96M02 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C10orf90Q96M02 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C10orf90Q96M02 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C10orf90Q96M02 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C10orf90Q96M02 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C10orf90Q96M02 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C10orf90Q96M02 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C10orf90Q96M02 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C10orf90Q96M02 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C10orf90Q96M02 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
C10orf90Q96M02 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C10orf90Q96M02 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C10orf90Q96M02 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C10orf90Q96M02 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C10orf90Q96M02 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C10orf90Q96M02 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C10orf90Q96M02 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C10orf90Q96M02 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C10orf90Q96M02 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C10orf90Q96M02 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C10orf90Q96M02 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C10orf90Q96M02 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C10orf90Q96M02 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C10orf90Q96M02 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C10orf90Q96M02 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
C10orf90Q96M02 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C10orf90Q96M02 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C10orf90Q96M02 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C10orf90Q96M02 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C10orf90Q96M02 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C10orf90Q96M02 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C10orf90Q96M02 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C10orf90Q96M02 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C10orf90Q96M02 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C10orf90Q96M02 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C10orf90Q96M02 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C10orf90Q96M02 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C10orf90Q96M02 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C10orf90Q96M02 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C10orf90Q96M02 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
C10orf90Q96M02 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C10orf90Q96M02 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
C10orf90Q96M02 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C10orf90Q96M02 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C10orf90Q96M02 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C10orf90Q96M02 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C10orf90Q96M02 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C10orf90Q96M02 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C10orf90Q96M02 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C10orf90Q96M02 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C10orf90Q96M02 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C10orf90Q96M02 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C10orf90Q96M02 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C10orf90Q96M02 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C10orf90Q96M02 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C10orf90Q96M02 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C10orf90Q96M02 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C10orf90Q96M02 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C10orf90Q96M02 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C10orf90Q96M02 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C10orf90Q96M02 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C10orf90Q96M02 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C10orf90Q96M02 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C10orf90Q96M02 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C10orf90Q96M02 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C10orf90Q96M02 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C10orf90Q96M02 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C10orf90Q96M02 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C10orf90Q96M02 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C10orf90Q96M02 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C10orf90Q96M02 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C10orf90Q96M02 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C10orf90Q96M02 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C10orf90Q96M02 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C10orf90Q96M02 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C10orf90Q96M02 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.5 ms