Protein–RNA interactions for Protein: Q96LY2

CCDC74B, Coiled-coil domain-containing protein 74B, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74BQ96LY2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC74BQ96LY2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC74BQ96LY2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC74BQ96LY2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC74BQ96LY2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC74BQ96LY2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC74BQ96LY2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC74BQ96LY2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC74BQ96LY2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC74BQ96LY2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC74BQ96LY2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC74BQ96LY2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC74BQ96LY2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC74BQ96LY2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC74BQ96LY2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC74BQ96LY2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC74BQ96LY2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC74BQ96LY2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC74BQ96LY2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC74BQ96LY2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC74BQ96LY2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC74BQ96LY2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC74BQ96LY2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC74BQ96LY2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC74BQ96LY2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC74BQ96LY2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC74BQ96LY2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC74BQ96LY2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC74BQ96LY2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC74BQ96LY2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC74BQ96LY2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC74BQ96LY2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC74BQ96LY2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC74BQ96LY2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC74BQ96LY2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC74BQ96LY2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC74BQ96LY2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC74BQ96LY2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC74BQ96LY2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC74BQ96LY2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC74BQ96LY2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC74BQ96LY2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC74BQ96LY2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC74BQ96LY2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC74BQ96LY2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC74BQ96LY2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC74BQ96LY2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC74BQ96LY2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC74BQ96LY2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC74BQ96LY2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC74BQ96LY2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC74BQ96LY2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC74BQ96LY2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC74BQ96LY2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC74BQ96LY2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC74BQ96LY2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC74BQ96LY2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC74BQ96LY2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC74BQ96LY2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC74BQ96LY2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC74BQ96LY2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC74BQ96LY2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC74BQ96LY2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC74BQ96LY2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC74BQ96LY2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC74BQ96LY2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC74BQ96LY2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC74BQ96LY2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC74BQ96LY2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC74BQ96LY2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC74BQ96LY2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC74BQ96LY2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC74BQ96LY2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC74BQ96LY2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC74BQ96LY2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC74BQ96LY2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC74BQ96LY2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC74BQ96LY2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC74BQ96LY2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC74BQ96LY2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC74BQ96LY2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC74BQ96LY2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC74BQ96LY2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC74BQ96LY2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC74BQ96LY2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC74BQ96LY2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC74BQ96LY2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC74BQ96LY2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC74BQ96LY2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC74BQ96LY2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC74BQ96LY2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC74BQ96LY2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC74BQ96LY2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC74BQ96LY2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC74BQ96LY2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC74BQ96LY2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC74BQ96LY2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC74BQ96LY2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC74BQ96LY2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC74BQ96LY2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms