Protein–RNA interactions for Protein: Q96LS8

C2orf48, Uncharacterized protein C2orf48, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf48Q96LS8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C2orf48Q96LS8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C2orf48Q96LS8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C2orf48Q96LS8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C2orf48Q96LS8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C2orf48Q96LS8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C2orf48Q96LS8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C2orf48Q96LS8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C2orf48Q96LS8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C2orf48Q96LS8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C2orf48Q96LS8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
C2orf48Q96LS8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
C2orf48Q96LS8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C2orf48Q96LS8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C2orf48Q96LS8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C2orf48Q96LS8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
C2orf48Q96LS8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C2orf48Q96LS8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C2orf48Q96LS8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C2orf48Q96LS8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C2orf48Q96LS8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C2orf48Q96LS8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C2orf48Q96LS8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C2orf48Q96LS8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C2orf48Q96LS8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C2orf48Q96LS8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C2orf48Q96LS8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C2orf48Q96LS8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C2orf48Q96LS8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C2orf48Q96LS8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C2orf48Q96LS8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C2orf48Q96LS8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C2orf48Q96LS8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C2orf48Q96LS8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C2orf48Q96LS8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C2orf48Q96LS8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C2orf48Q96LS8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C2orf48Q96LS8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C2orf48Q96LS8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
C2orf48Q96LS8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C2orf48Q96LS8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C2orf48Q96LS8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C2orf48Q96LS8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C2orf48Q96LS8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C2orf48Q96LS8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C2orf48Q96LS8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C2orf48Q96LS8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C2orf48Q96LS8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C2orf48Q96LS8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C2orf48Q96LS8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C2orf48Q96LS8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C2orf48Q96LS8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C2orf48Q96LS8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C2orf48Q96LS8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C2orf48Q96LS8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C2orf48Q96LS8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C2orf48Q96LS8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C2orf48Q96LS8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C2orf48Q96LS8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C2orf48Q96LS8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C2orf48Q96LS8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C2orf48Q96LS8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C2orf48Q96LS8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C2orf48Q96LS8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C2orf48Q96LS8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C2orf48Q96LS8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C2orf48Q96LS8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C2orf48Q96LS8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C2orf48Q96LS8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C2orf48Q96LS8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C2orf48Q96LS8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C2orf48Q96LS8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C2orf48Q96LS8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C2orf48Q96LS8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C2orf48Q96LS8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C2orf48Q96LS8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C2orf48Q96LS8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C2orf48Q96LS8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C2orf48Q96LS8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C2orf48Q96LS8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C2orf48Q96LS8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C2orf48Q96LS8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C2orf48Q96LS8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C2orf48Q96LS8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C2orf48Q96LS8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C2orf48Q96LS8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C2orf48Q96LS8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C2orf48Q96LS8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C2orf48Q96LS8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C2orf48Q96LS8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C2orf48Q96LS8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C2orf48Q96LS8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C2orf48Q96LS8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C2orf48Q96LS8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C2orf48Q96LS8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C2orf48Q96LS8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
C2orf48Q96LS8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C2orf48Q96LS8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C2orf48Q96LS8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C2orf48Q96LS8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms