Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PKNOX2Q96KN3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PKNOX2Q96KN3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PKNOX2Q96KN3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PKNOX2Q96KN3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PKNOX2Q96KN3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PKNOX2Q96KN3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PKNOX2Q96KN3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PKNOX2Q96KN3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PKNOX2Q96KN3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PKNOX2Q96KN3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PKNOX2Q96KN3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PKNOX2Q96KN3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PKNOX2Q96KN3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PKNOX2Q96KN3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PKNOX2Q96KN3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PKNOX2Q96KN3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PKNOX2Q96KN3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PKNOX2Q96KN3 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PKNOX2Q96KN3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PKNOX2Q96KN3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PKNOX2Q96KN3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PKNOX2Q96KN3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PKNOX2Q96KN3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PKNOX2Q96KN3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PKNOX2Q96KN3 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PKNOX2Q96KN3 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PKNOX2Q96KN3 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PKNOX2Q96KN3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PKNOX2Q96KN3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PKNOX2Q96KN3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PKNOX2Q96KN3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PKNOX2Q96KN3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PKNOX2Q96KN3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PKNOX2Q96KN3 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PKNOX2Q96KN3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PKNOX2Q96KN3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PKNOX2Q96KN3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PKNOX2Q96KN3 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PKNOX2Q96KN3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PKNOX2Q96KN3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PKNOX2Q96KN3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PKNOX2Q96KN3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PKNOX2Q96KN3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PKNOX2Q96KN3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PKNOX2Q96KN3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PKNOX2Q96KN3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PKNOX2Q96KN3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PKNOX2Q96KN3 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PKNOX2Q96KN3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PKNOX2Q96KN3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PKNOX2Q96KN3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PKNOX2Q96KN3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PKNOX2Q96KN3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PKNOX2Q96KN3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PKNOX2Q96KN3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PKNOX2Q96KN3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PKNOX2Q96KN3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PKNOX2Q96KN3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PKNOX2Q96KN3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PKNOX2Q96KN3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PKNOX2Q96KN3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PKNOX2Q96KN3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PKNOX2Q96KN3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PKNOX2Q96KN3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PKNOX2Q96KN3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PKNOX2Q96KN3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PKNOX2Q96KN3 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PKNOX2Q96KN3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PKNOX2Q96KN3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PKNOX2Q96KN3 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PKNOX2Q96KN3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PKNOX2Q96KN3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PKNOX2Q96KN3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PKNOX2Q96KN3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PKNOX2Q96KN3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PKNOX2Q96KN3 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PKNOX2Q96KN3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PKNOX2Q96KN3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PKNOX2Q96KN3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PKNOX2Q96KN3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PKNOX2Q96KN3 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PKNOX2Q96KN3 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PKNOX2Q96KN3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PKNOX2Q96KN3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PKNOX2Q96KN3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PKNOX2Q96KN3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PKNOX2Q96KN3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PKNOX2Q96KN3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PKNOX2Q96KN3 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PKNOX2Q96KN3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PKNOX2Q96KN3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PKNOX2Q96KN3 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PKNOX2Q96KN3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PKNOX2Q96KN3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PKNOX2Q96KN3 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PKNOX2Q96KN3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PKNOX2Q96KN3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PKNOX2Q96KN3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PKNOX2Q96KN3 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms