Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SHDQ96IW2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SHDQ96IW2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SHDQ96IW2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SHDQ96IW2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SHDQ96IW2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SHDQ96IW2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SHDQ96IW2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SHDQ96IW2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SHDQ96IW2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SHDQ96IW2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SHDQ96IW2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SHDQ96IW2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SHDQ96IW2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SHDQ96IW2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SHDQ96IW2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SHDQ96IW2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SHDQ96IW2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SHDQ96IW2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHDQ96IW2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHDQ96IW2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHDQ96IW2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SHDQ96IW2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SHDQ96IW2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHDQ96IW2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHDQ96IW2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHDQ96IW2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHDQ96IW2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHDQ96IW2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SHDQ96IW2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHDQ96IW2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHDQ96IW2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHDQ96IW2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHDQ96IW2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHDQ96IW2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHDQ96IW2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHDQ96IW2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SHDQ96IW2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SHDQ96IW2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SHDQ96IW2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SHDQ96IW2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SHDQ96IW2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SHDQ96IW2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SHDQ96IW2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SHDQ96IW2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SHDQ96IW2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SHDQ96IW2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SHDQ96IW2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SHDQ96IW2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SHDQ96IW2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SHDQ96IW2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SHDQ96IW2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SHDQ96IW2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SHDQ96IW2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SHDQ96IW2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SHDQ96IW2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SHDQ96IW2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SHDQ96IW2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SHDQ96IW2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SHDQ96IW2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SHDQ96IW2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SHDQ96IW2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SHDQ96IW2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SHDQ96IW2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SHDQ96IW2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SHDQ96IW2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHDQ96IW2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHDQ96IW2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHDQ96IW2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHDQ96IW2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHDQ96IW2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHDQ96IW2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHDQ96IW2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SHDQ96IW2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHDQ96IW2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHDQ96IW2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHDQ96IW2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHDQ96IW2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHDQ96IW2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHDQ96IW2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHDQ96IW2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHDQ96IW2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHDQ96IW2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHDQ96IW2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHDQ96IW2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHDQ96IW2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SHDQ96IW2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHDQ96IW2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHDQ96IW2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHDQ96IW2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHDQ96IW2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHDQ96IW2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHDQ96IW2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHDQ96IW2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SHDQ96IW2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHDQ96IW2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SHDQ96IW2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHDQ96IW2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHDQ96IW2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHDQ96IW2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms