Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZBED3Q96IU2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ZBED3Q96IU2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZBED3Q96IU2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZBED3Q96IU2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZBED3Q96IU2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
ZBED3Q96IU2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZBED3Q96IU2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZBED3Q96IU2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZBED3Q96IU2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZBED3Q96IU2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZBED3Q96IU2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZBED3Q96IU2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZBED3Q96IU2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZBED3Q96IU2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZBED3Q96IU2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZBED3Q96IU2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZBED3Q96IU2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZBED3Q96IU2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZBED3Q96IU2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
ZBED3Q96IU2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZBED3Q96IU2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZBED3Q96IU2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZBED3Q96IU2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZBED3Q96IU2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZBED3Q96IU2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZBED3Q96IU2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
ZBED3Q96IU2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZBED3Q96IU2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZBED3Q96IU2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZBED3Q96IU2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
ZBED3Q96IU2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZBED3Q96IU2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZBED3Q96IU2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZBED3Q96IU2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ZBED3Q96IU2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ZBED3Q96IU2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ZBED3Q96IU2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ZBED3Q96IU2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ZBED3Q96IU2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ZBED3Q96IU2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ZBED3Q96IU2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ZBED3Q96IU2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ZBED3Q96IU2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ZBED3Q96IU2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
ZBED3Q96IU2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZBED3Q96IU2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZBED3Q96IU2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZBED3Q96IU2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZBED3Q96IU2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZBED3Q96IU2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
ZBED3Q96IU2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZBED3Q96IU2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZBED3Q96IU2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZBED3Q96IU2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZBED3Q96IU2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZBED3Q96IU2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZBED3Q96IU2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
ZBED3Q96IU2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZBED3Q96IU2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZBED3Q96IU2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZBED3Q96IU2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZBED3Q96IU2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZBED3Q96IU2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZBED3Q96IU2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZBED3Q96IU2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZBED3Q96IU2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZBED3Q96IU2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZBED3Q96IU2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZBED3Q96IU2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZBED3Q96IU2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZBED3Q96IU2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZBED3Q96IU2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZBED3Q96IU2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ZBED3Q96IU2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZBED3Q96IU2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZBED3Q96IU2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZBED3Q96IU2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZBED3Q96IU2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZBED3Q96IU2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZBED3Q96IU2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZBED3Q96IU2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZBED3Q96IU2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZBED3Q96IU2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZBED3Q96IU2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZBED3Q96IU2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZBED3Q96IU2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZBED3Q96IU2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZBED3Q96IU2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
ZBED3Q96IU2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZBED3Q96IU2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
ZBED3Q96IU2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
ZBED3Q96IU2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZBED3Q96IU2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZBED3Q96IU2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZBED3Q96IU2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZBED3Q96IU2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZBED3Q96IU2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZBED3Q96IU2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZBED3Q96IU2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
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