Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCMH1Q96GD3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCMH1Q96GD3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCMH1Q96GD3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCMH1Q96GD3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCMH1Q96GD3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCMH1Q96GD3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCMH1Q96GD3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCMH1Q96GD3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCMH1Q96GD3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCMH1Q96GD3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCMH1Q96GD3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCMH1Q96GD3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCMH1Q96GD3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCMH1Q96GD3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCMH1Q96GD3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCMH1Q96GD3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCMH1Q96GD3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCMH1Q96GD3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCMH1Q96GD3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCMH1Q96GD3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCMH1Q96GD3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCMH1Q96GD3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCMH1Q96GD3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCMH1Q96GD3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCMH1Q96GD3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCMH1Q96GD3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCMH1Q96GD3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCMH1Q96GD3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCMH1Q96GD3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCMH1Q96GD3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCMH1Q96GD3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCMH1Q96GD3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCMH1Q96GD3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SCMH1Q96GD3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCMH1Q96GD3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCMH1Q96GD3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCMH1Q96GD3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SCMH1Q96GD3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCMH1Q96GD3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCMH1Q96GD3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCMH1Q96GD3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCMH1Q96GD3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCMH1Q96GD3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCMH1Q96GD3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCMH1Q96GD3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCMH1Q96GD3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCMH1Q96GD3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SCMH1Q96GD3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SCMH1Q96GD3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCMH1Q96GD3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCMH1Q96GD3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCMH1Q96GD3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SCMH1Q96GD3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCMH1Q96GD3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCMH1Q96GD3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCMH1Q96GD3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCMH1Q96GD3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCMH1Q96GD3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCMH1Q96GD3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCMH1Q96GD3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCMH1Q96GD3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCMH1Q96GD3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCMH1Q96GD3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCMH1Q96GD3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCMH1Q96GD3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCMH1Q96GD3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCMH1Q96GD3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCMH1Q96GD3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SCMH1Q96GD3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCMH1Q96GD3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCMH1Q96GD3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCMH1Q96GD3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCMH1Q96GD3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCMH1Q96GD3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCMH1Q96GD3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCMH1Q96GD3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCMH1Q96GD3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCMH1Q96GD3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCMH1Q96GD3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SCMH1Q96GD3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCMH1Q96GD3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCMH1Q96GD3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCMH1Q96GD3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCMH1Q96GD3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCMH1Q96GD3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCMH1Q96GD3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCMH1Q96GD3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCMH1Q96GD3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCMH1Q96GD3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCMH1Q96GD3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCMH1Q96GD3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCMH1Q96GD3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCMH1Q96GD3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCMH1Q96GD3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCMH1Q96GD3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCMH1Q96GD3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCMH1Q96GD3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCMH1Q96GD3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCMH1Q96GD3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.6 ms