Protein–RNA interactions for Protein: Q96FC9

DDX11, ATP-dependent DNA helicase DDX11, humanhuman

Predictions only

Length 970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX11Q96FC9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
DDX11Q96FC9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
DDX11Q96FC9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DDX11Q96FC9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DDX11Q96FC9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DDX11Q96FC9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DDX11Q96FC9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DDX11Q96FC9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DDX11Q96FC9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DDX11Q96FC9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DDX11Q96FC9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
DDX11Q96FC9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
DDX11Q96FC9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
DDX11Q96FC9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DDX11Q96FC9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DDX11Q96FC9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
DDX11Q96FC9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
DDX11Q96FC9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DDX11Q96FC9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
DDX11Q96FC9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
DDX11Q96FC9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DDX11Q96FC9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DDX11Q96FC9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DDX11Q96FC9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DDX11Q96FC9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DDX11Q96FC9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DDX11Q96FC9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DDX11Q96FC9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DDX11Q96FC9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DDX11Q96FC9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
DDX11Q96FC9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DDX11Q96FC9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
DDX11Q96FC9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
DDX11Q96FC9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
DDX11Q96FC9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DDX11Q96FC9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DDX11Q96FC9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DDX11Q96FC9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DDX11Q96FC9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
DDX11Q96FC9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DDX11Q96FC9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DDX11Q96FC9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DDX11Q96FC9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DDX11Q96FC9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DDX11Q96FC9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DDX11Q96FC9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DDX11Q96FC9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
DDX11Q96FC9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DDX11Q96FC9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DDX11Q96FC9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
DDX11Q96FC9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
DDX11Q96FC9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
DDX11Q96FC9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
DDX11Q96FC9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DDX11Q96FC9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
DDX11Q96FC9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DDX11Q96FC9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DDX11Q96FC9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DDX11Q96FC9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DDX11Q96FC9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDX11Q96FC9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDX11Q96FC9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDX11Q96FC9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDX11Q96FC9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDX11Q96FC9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDX11Q96FC9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDX11Q96FC9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDX11Q96FC9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
DDX11Q96FC9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DDX11Q96FC9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DDX11Q96FC9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
DDX11Q96FC9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
DDX11Q96FC9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DDX11Q96FC9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
DDX11Q96FC9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
DDX11Q96FC9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
DDX11Q96FC9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DDX11Q96FC9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
DDX11Q96FC9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
DDX11Q96FC9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
DDX11Q96FC9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
DDX11Q96FC9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DDX11Q96FC9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DDX11Q96FC9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DDX11Q96FC9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DDX11Q96FC9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DDX11Q96FC9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DDX11Q96FC9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DDX11Q96FC9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DDX11Q96FC9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DDX11Q96FC9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DDX11Q96FC9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DDX11Q96FC9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DDX11Q96FC9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
DDX11Q96FC9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DDX11Q96FC9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DDX11Q96FC9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDX11Q96FC9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDX11Q96FC9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDX11Q96FC9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms