Protein–RNA interactions for Protein: Q96EU6

RRP36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP36Q96EU6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RRP36Q96EU6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RRP36Q96EU6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RRP36Q96EU6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RRP36Q96EU6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RRP36Q96EU6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RRP36Q96EU6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RRP36Q96EU6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RRP36Q96EU6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RRP36Q96EU6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RRP36Q96EU6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RRP36Q96EU6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RRP36Q96EU6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RRP36Q96EU6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RRP36Q96EU6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RRP36Q96EU6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RRP36Q96EU6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RRP36Q96EU6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RRP36Q96EU6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
RRP36Q96EU6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RRP36Q96EU6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
RRP36Q96EU6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RRP36Q96EU6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RRP36Q96EU6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RRP36Q96EU6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RRP36Q96EU6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RRP36Q96EU6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RRP36Q96EU6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RRP36Q96EU6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RRP36Q96EU6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RRP36Q96EU6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RRP36Q96EU6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RRP36Q96EU6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RRP36Q96EU6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RRP36Q96EU6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RRP36Q96EU6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RRP36Q96EU6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RRP36Q96EU6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RRP36Q96EU6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RRP36Q96EU6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
RRP36Q96EU6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RRP36Q96EU6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RRP36Q96EU6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RRP36Q96EU6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RRP36Q96EU6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RRP36Q96EU6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RRP36Q96EU6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RRP36Q96EU6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RRP36Q96EU6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RRP36Q96EU6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RRP36Q96EU6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
RRP36Q96EU6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RRP36Q96EU6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RRP36Q96EU6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RRP36Q96EU6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RRP36Q96EU6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RRP36Q96EU6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RRP36Q96EU6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RRP36Q96EU6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RRP36Q96EU6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RRP36Q96EU6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RRP36Q96EU6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RRP36Q96EU6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RRP36Q96EU6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RRP36Q96EU6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RRP36Q96EU6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RRP36Q96EU6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RRP36Q96EU6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RRP36Q96EU6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RRP36Q96EU6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RRP36Q96EU6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RRP36Q96EU6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RRP36Q96EU6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RRP36Q96EU6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RRP36Q96EU6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RRP36Q96EU6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RRP36Q96EU6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
RRP36Q96EU6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
RRP36Q96EU6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RRP36Q96EU6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RRP36Q96EU6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RRP36Q96EU6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RRP36Q96EU6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
RRP36Q96EU6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RRP36Q96EU6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RRP36Q96EU6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RRP36Q96EU6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RRP36Q96EU6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RRP36Q96EU6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RRP36Q96EU6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RRP36Q96EU6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RRP36Q96EU6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RRP36Q96EU6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RRP36Q96EU6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RRP36Q96EU6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RRP36Q96EU6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RRP36Q96EU6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RRP36Q96EU6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RRP36Q96EU6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RRP36Q96EU6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms