Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ9

CMTM5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM5Q96DZ9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CMTM5Q96DZ9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CMTM5Q96DZ9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CMTM5Q96DZ9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CMTM5Q96DZ9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CMTM5Q96DZ9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CMTM5Q96DZ9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CMTM5Q96DZ9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CMTM5Q96DZ9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CMTM5Q96DZ9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CMTM5Q96DZ9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CMTM5Q96DZ9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CMTM5Q96DZ9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CMTM5Q96DZ9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CMTM5Q96DZ9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CMTM5Q96DZ9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CMTM5Q96DZ9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CMTM5Q96DZ9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CMTM5Q96DZ9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CMTM5Q96DZ9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CMTM5Q96DZ9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CMTM5Q96DZ9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CMTM5Q96DZ9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CMTM5Q96DZ9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CMTM5Q96DZ9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CMTM5Q96DZ9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CMTM5Q96DZ9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CMTM5Q96DZ9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CMTM5Q96DZ9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CMTM5Q96DZ9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CMTM5Q96DZ9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CMTM5Q96DZ9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CMTM5Q96DZ9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CMTM5Q96DZ9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CMTM5Q96DZ9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CMTM5Q96DZ9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CMTM5Q96DZ9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CMTM5Q96DZ9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CMTM5Q96DZ9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CMTM5Q96DZ9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CMTM5Q96DZ9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CMTM5Q96DZ9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CMTM5Q96DZ9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CMTM5Q96DZ9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CMTM5Q96DZ9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CMTM5Q96DZ9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CMTM5Q96DZ9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CMTM5Q96DZ9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CMTM5Q96DZ9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CMTM5Q96DZ9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CMTM5Q96DZ9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CMTM5Q96DZ9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CMTM5Q96DZ9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CMTM5Q96DZ9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CMTM5Q96DZ9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CMTM5Q96DZ9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CMTM5Q96DZ9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CMTM5Q96DZ9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CMTM5Q96DZ9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CMTM5Q96DZ9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CMTM5Q96DZ9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CMTM5Q96DZ9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CMTM5Q96DZ9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CMTM5Q96DZ9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CMTM5Q96DZ9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CMTM5Q96DZ9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CMTM5Q96DZ9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CMTM5Q96DZ9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CMTM5Q96DZ9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CMTM5Q96DZ9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CMTM5Q96DZ9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CMTM5Q96DZ9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CMTM5Q96DZ9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CMTM5Q96DZ9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CMTM5Q96DZ9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CMTM5Q96DZ9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CMTM5Q96DZ9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CMTM5Q96DZ9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CMTM5Q96DZ9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CMTM5Q96DZ9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CMTM5Q96DZ9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CMTM5Q96DZ9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CMTM5Q96DZ9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CMTM5Q96DZ9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CMTM5Q96DZ9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CMTM5Q96DZ9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CMTM5Q96DZ9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CMTM5Q96DZ9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CMTM5Q96DZ9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CMTM5Q96DZ9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CMTM5Q96DZ9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CMTM5Q96DZ9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CMTM5Q96DZ9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CMTM5Q96DZ9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CMTM5Q96DZ9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CMTM5Q96DZ9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CMTM5Q96DZ9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CMTM5Q96DZ9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CMTM5Q96DZ9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CMTM5Q96DZ9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms