Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX8

RTP4, Receptor-transporting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP4Q96DX8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RTP4Q96DX8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RTP4Q96DX8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RTP4Q96DX8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RTP4Q96DX8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RTP4Q96DX8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RTP4Q96DX8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RTP4Q96DX8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RTP4Q96DX8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTP4Q96DX8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTP4Q96DX8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTP4Q96DX8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTP4Q96DX8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTP4Q96DX8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTP4Q96DX8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTP4Q96DX8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTP4Q96DX8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTP4Q96DX8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTP4Q96DX8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTP4Q96DX8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTP4Q96DX8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTP4Q96DX8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTP4Q96DX8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTP4Q96DX8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTP4Q96DX8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTP4Q96DX8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTP4Q96DX8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RTP4Q96DX8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RTP4Q96DX8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RTP4Q96DX8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RTP4Q96DX8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RTP4Q96DX8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTP4Q96DX8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTP4Q96DX8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTP4Q96DX8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTP4Q96DX8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTP4Q96DX8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTP4Q96DX8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTP4Q96DX8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTP4Q96DX8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RTP4Q96DX8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RTP4Q96DX8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RTP4Q96DX8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RTP4Q96DX8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RTP4Q96DX8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RTP4Q96DX8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RTP4Q96DX8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RTP4Q96DX8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RTP4Q96DX8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTP4Q96DX8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTP4Q96DX8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RTP4Q96DX8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTP4Q96DX8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTP4Q96DX8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTP4Q96DX8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTP4Q96DX8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTP4Q96DX8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RTP4Q96DX8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RTP4Q96DX8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RTP4Q96DX8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RTP4Q96DX8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RTP4Q96DX8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RTP4Q96DX8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RTP4Q96DX8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RTP4Q96DX8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTP4Q96DX8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTP4Q96DX8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTP4Q96DX8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTP4Q96DX8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTP4Q96DX8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTP4Q96DX8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTP4Q96DX8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTP4Q96DX8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RTP4Q96DX8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RTP4Q96DX8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RTP4Q96DX8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RTP4Q96DX8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RTP4Q96DX8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RTP4Q96DX8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RTP4Q96DX8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RTP4Q96DX8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RTP4Q96DX8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RTP4Q96DX8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RTP4Q96DX8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RTP4Q96DX8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RTP4Q96DX8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RTP4Q96DX8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RTP4Q96DX8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RTP4Q96DX8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RTP4Q96DX8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RTP4Q96DX8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RTP4Q96DX8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RTP4Q96DX8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RTP4Q96DX8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RTP4Q96DX8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RTP4Q96DX8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RTP4Q96DX8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RTP4Q96DX8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RTP4Q96DX8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RTP4Q96DX8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms