Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB5

RMDN1, Regulator of microtubule dynamics protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RMDN1Q96DB5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RMDN1Q96DB5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RMDN1Q96DB5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RMDN1Q96DB5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RMDN1Q96DB5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RMDN1Q96DB5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RMDN1Q96DB5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RMDN1Q96DB5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RMDN1Q96DB5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RMDN1Q96DB5 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RMDN1Q96DB5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RMDN1Q96DB5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RMDN1Q96DB5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RMDN1Q96DB5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RMDN1Q96DB5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RMDN1Q96DB5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RMDN1Q96DB5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RMDN1Q96DB5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RMDN1Q96DB5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RMDN1Q96DB5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RMDN1Q96DB5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RMDN1Q96DB5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RMDN1Q96DB5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RMDN1Q96DB5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RMDN1Q96DB5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RMDN1Q96DB5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RMDN1Q96DB5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RMDN1Q96DB5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RMDN1Q96DB5 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RMDN1Q96DB5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RMDN1Q96DB5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RMDN1Q96DB5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RMDN1Q96DB5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RMDN1Q96DB5 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RMDN1Q96DB5 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RMDN1Q96DB5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RMDN1Q96DB5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RMDN1Q96DB5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RMDN1Q96DB5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RMDN1Q96DB5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RMDN1Q96DB5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RMDN1Q96DB5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RMDN1Q96DB5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RMDN1Q96DB5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RMDN1Q96DB5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RMDN1Q96DB5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RMDN1Q96DB5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RMDN1Q96DB5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RMDN1Q96DB5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RMDN1Q96DB5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RMDN1Q96DB5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RMDN1Q96DB5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RMDN1Q96DB5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RMDN1Q96DB5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RMDN1Q96DB5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RMDN1Q96DB5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RMDN1Q96DB5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RMDN1Q96DB5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RMDN1Q96DB5 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RMDN1Q96DB5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RMDN1Q96DB5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RMDN1Q96DB5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RMDN1Q96DB5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RMDN1Q96DB5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RMDN1Q96DB5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RMDN1Q96DB5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RMDN1Q96DB5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RMDN1Q96DB5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RMDN1Q96DB5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RMDN1Q96DB5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RMDN1Q96DB5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RMDN1Q96DB5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RMDN1Q96DB5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RMDN1Q96DB5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RMDN1Q96DB5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RMDN1Q96DB5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RMDN1Q96DB5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RMDN1Q96DB5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RMDN1Q96DB5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RMDN1Q96DB5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RMDN1Q96DB5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RMDN1Q96DB5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RMDN1Q96DB5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RMDN1Q96DB5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RMDN1Q96DB5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RMDN1Q96DB5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RMDN1Q96DB5 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RMDN1Q96DB5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RMDN1Q96DB5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RMDN1Q96DB5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RMDN1Q96DB5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RMDN1Q96DB5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RMDN1Q96DB5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RMDN1Q96DB5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RMDN1Q96DB5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RMDN1Q96DB5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RMDN1Q96DB5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RMDN1Q96DB5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RMDN1Q96DB5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RMDN1Q96DB5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms