Protein–RNA interactions for Protein: Q96AE7

TTC17, Tetratricopeptide repeat protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC17Q96AE7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TTC17Q96AE7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TTC17Q96AE7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTC17Q96AE7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTC17Q96AE7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC17Q96AE7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC17Q96AE7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC17Q96AE7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC17Q96AE7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC17Q96AE7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC17Q96AE7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC17Q96AE7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTC17Q96AE7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTC17Q96AE7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTC17Q96AE7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTC17Q96AE7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTC17Q96AE7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTC17Q96AE7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTC17Q96AE7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTC17Q96AE7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC17Q96AE7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC17Q96AE7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC17Q96AE7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC17Q96AE7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC17Q96AE7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC17Q96AE7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC17Q96AE7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC17Q96AE7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC17Q96AE7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC17Q96AE7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC17Q96AE7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC17Q96AE7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC17Q96AE7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC17Q96AE7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC17Q96AE7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC17Q96AE7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC17Q96AE7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTC17Q96AE7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTC17Q96AE7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTC17Q96AE7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTC17Q96AE7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTC17Q96AE7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTC17Q96AE7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TTC17Q96AE7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TTC17Q96AE7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC17Q96AE7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC17Q96AE7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC17Q96AE7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC17Q96AE7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC17Q96AE7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC17Q96AE7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC17Q96AE7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC17Q96AE7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC17Q96AE7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTC17Q96AE7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTC17Q96AE7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTC17Q96AE7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTC17Q96AE7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC17Q96AE7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC17Q96AE7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC17Q96AE7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC17Q96AE7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC17Q96AE7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC17Q96AE7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC17Q96AE7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC17Q96AE7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC17Q96AE7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC17Q96AE7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC17Q96AE7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC17Q96AE7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC17Q96AE7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC17Q96AE7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC17Q96AE7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC17Q96AE7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC17Q96AE7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC17Q96AE7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC17Q96AE7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC17Q96AE7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC17Q96AE7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC17Q96AE7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC17Q96AE7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC17Q96AE7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTC17Q96AE7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTC17Q96AE7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTC17Q96AE7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTC17Q96AE7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTC17Q96AE7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTC17Q96AE7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTC17Q96AE7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC17Q96AE7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC17Q96AE7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC17Q96AE7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC17Q96AE7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC17Q96AE7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC17Q96AE7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC17Q96AE7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC17Q96AE7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC17Q96AE7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC17Q96AE7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC17Q96AE7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.5 ms