Protein–RNA interactions for Protein: Q969Z0

TBRG4, Protein TBRG4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG4Q969Z0 NUBP1-201ENST00000283027 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.453e-9■■■■■ 78.5
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TBRG4Q969Z0 ATAT1-205ENST00000376483 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.453e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 THRAP3-203ENST00000469141 3339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.463e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 RSU1-202ENST00000377911 955 ntTSL 1 (best)12.17□□□□□ -0.461e-8■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 INTS11-246ENST00000534345 485 ntTSL 412.08□□□□□ -0.483e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 THRAP3-201ENST00000354618 4432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.483e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 ATAT1-201ENST00000318999 2611 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.483e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 SMIM17-202ENST00000600547 573 ntTSL 4 BASIC12.03□□□□□ -0.483e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 IDI2-AS1-204ENST00000437374 896 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.493e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 SMIM17-201ENST00000598409 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.493e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 TBC1D5-207ENST00000425944 591 ntTSL 411.99□□□□□ -0.493e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 MIR194-2HG-201ENST00000413053 3647 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.493e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 CYP4F3-209ENST00000609670 337 ntTSL 311.96□□□□□ -0.493e-9■■■■■ 78.5
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TBRG4Q969Z0 CYP4F3-206ENST00000591058 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.53e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 NFRKB-201ENST00000446488 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.513e-7■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 RAB30-AS1-203ENST00000527627 504 ntTSL 311.83□□□□□ -0.523e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 INTS11-231ENST00000526797 659 ntTSL 411.83□□□□□ -0.523e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 TTC7B-206ENST00000555005 2730 ntTSL 211.81□□□□□ -0.523e-9■■■■■ 78.5
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TBRG4Q969Z0 AC008982.1-201ENST00000594769 963 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.553e-9■■■■■ 78.5
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TBRG4Q969Z0 MAPT-202ENST00000334239 1107 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.563e-9■■■■■ 78.5
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TBRG4Q969Z0 PRPF40B-203ENST00000508736 1861 ntTSL 511.44□□□□□ -0.583e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 WDR37-202ENST00000358220 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.593e-9■■■■■ 78.5
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TBRG4Q969Z0 ATAT1-203ENST00000329992 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.593e-9■■■■■ 78.5
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TBRG4Q969Z0 CLU-201ENST00000316403 3080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.593e-9■■■■■ 78.5
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TBRG4Q969Z0 PITRM1-202ENST00000380989 3487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.623e-9■■■■■ 78.5
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TBRG4Q969Z0 MMS19-214ENST00000477575 986 ntTSL 211.13□□□□□ -0.633e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 DHX15-201ENST00000336812 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.633e-9■■■■■ 78.5
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TBRG4Q969Z0 TCOF1-203ENST00000394269 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.643e-9■■■■■ 78.5
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TBRG4Q969Z0 RSU1-201ENST00000345264 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.641e-8■■■■■ 78.5
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TBRG4Q969Z0 RASGRF2-205ENST00000514946 548 ntTSL 510.23□□□□□ -0.773e-9■■■■■ 78.5
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TBRG4Q969Z0 ZNF3-205ENST00000413658 1441 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.793e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 PRPF40B-204ENST00000527253 742 ntTSL 310.09□□□□□ -0.793e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 TBC1D5-202ENST00000412981 592 ntTSL 310.07□□□□□ -0.83e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 MMS19-202ENST00000355839 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.83e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 CYP19A1-211ENST00000557934 1196 ntTSL 1 (best)10.03□□□□□ -0.83e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 KALRN-203ENST00000354186 10586 ntAPPRIS ALT2 TSL 59.95□□□□□ -0.823e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 BABAM2-202ENST00000344773 1852 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.823e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 WRAP53-201ENST00000316024 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.823e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 NUBP1-205ENST00000573663 472 ntTSL 39.88□□□□□ -0.833e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 TBC1D5-229ENST00000497531 672 ntTSL 39.86□□□□□ -0.833e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 MPHOSPH8-203ENST00000449056 717 ntTSL 59.79□□□□□ -0.843e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 ZNF3-215ENST00000487620 2660 ntTSL 29.77□□□□□ -0.853e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 MSH2-202ENST00000406134 3628 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.853e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 ATP2B4-203ENST00000357681 8968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.883e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 ELMSAN1-211ENST00000486739 534 ntTSL 49.58□□□□□ -0.883e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 AC108488.1-205ENST00000438482 914 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.883e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 FBXW7-212ENST00000604872 970 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.883e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 TBC1D5-205ENST00000415814 852 ntTSL 39.55□□□□□ -0.883e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 KALRN-210ENST00000459915 2080 ntTSL 29.53□□□□□ -0.883e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 TBC1D5-211ENST00000430169 492 ntTSL 39.53□□□□□ -0.883e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 CNOT1-207ENST00000565605 739 ntTSL 49.47□□□□□ -0.893e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 CYP19A1-217ENST00000559980 993 ntTSL 59.43□□□□□ -0.93e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 RHPN2-201ENST00000254260 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.93e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 NUDCD3-203ENST00000460110 3641 ntTSL 1 (best)9.37□□□□□ -0.913e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 FBXW7-205ENST00000603548 2562 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.913e-9■■■■■ 78.5
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