Protein–RNA interactions for Protein: Q969T4

UBE2E3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3Q969T4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE2E3Q969T4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE2E3Q969T4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE2E3Q969T4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE2E3Q969T4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE2E3Q969T4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE2E3Q969T4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE2E3Q969T4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE2E3Q969T4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE2E3Q969T4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE2E3Q969T4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE2E3Q969T4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE2E3Q969T4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE2E3Q969T4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE2E3Q969T4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE2E3Q969T4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE2E3Q969T4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE2E3Q969T4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE2E3Q969T4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE2E3Q969T4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE2E3Q969T4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE2E3Q969T4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE2E3Q969T4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE2E3Q969T4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE2E3Q969T4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE2E3Q969T4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE2E3Q969T4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE2E3Q969T4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE2E3Q969T4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE2E3Q969T4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE2E3Q969T4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE2E3Q969T4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE2E3Q969T4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE2E3Q969T4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE2E3Q969T4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE2E3Q969T4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE2E3Q969T4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE2E3Q969T4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE2E3Q969T4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE2E3Q969T4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE2E3Q969T4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE2E3Q969T4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE2E3Q969T4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE2E3Q969T4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE2E3Q969T4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE2E3Q969T4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE2E3Q969T4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE2E3Q969T4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE2E3Q969T4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE2E3Q969T4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE2E3Q969T4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE2E3Q969T4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE2E3Q969T4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE2E3Q969T4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE2E3Q969T4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE2E3Q969T4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE2E3Q969T4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE2E3Q969T4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE2E3Q969T4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE2E3Q969T4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE2E3Q969T4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE2E3Q969T4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE2E3Q969T4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE2E3Q969T4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE2E3Q969T4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE2E3Q969T4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE2E3Q969T4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE2E3Q969T4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE2E3Q969T4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE2E3Q969T4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE2E3Q969T4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE2E3Q969T4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE2E3Q969T4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE2E3Q969T4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE2E3Q969T4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE2E3Q969T4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE2E3Q969T4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE2E3Q969T4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE2E3Q969T4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE2E3Q969T4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE2E3Q969T4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE2E3Q969T4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE2E3Q969T4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE2E3Q969T4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE2E3Q969T4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE2E3Q969T4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE2E3Q969T4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE2E3Q969T4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE2E3Q969T4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE2E3Q969T4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE2E3Q969T4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE2E3Q969T4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE2E3Q969T4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE2E3Q969T4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE2E3Q969T4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE2E3Q969T4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE2E3Q969T4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE2E3Q969T4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE2E3Q969T4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE2E3Q969T4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms